ELK4

ELK4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1BC7, 1BC8, 1HBX, 1K6O
Ідентифікатори
Символи	ELK4, SAP1, ETS transcription factor, ETS transcription factor ELK4
Зовнішні ІД	OMIM: 600246 MGI: 102853 HomoloGene: 1492 GeneCards: ELK4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • chromatin binding; • GO:0001104 transcription coregulator activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• нуклеоплазма; • клітинне ядро; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• histone H3 deacetylation; • диференціація клітин; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	2005
	13714
	ENSG00000158711
	ENSMUSG00000026436
	P28324
	P41158
	NM_001973; NM_021795
NM_007923; NM_001376954; NM_001376955; NM_001376956; NM_001376957;
	NM_001376958; NM_001376959
	NP_001964; NP_068567; NP_068567.1
NP_031949; NP_001363883; NP_001363884; NP_001363885; NP_001363886;
	NP_001363887; NP_001363888
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ELK4 (англ. ELK4, ETS transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 431 амінокислот, а молекулярна маса — 46 900^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDSAITLWQF	LLQLLQKPQN	KHMICWTSND	GQFKLLQAEE	VARLWGIRKN
KPNMNYDKLS	RALRYYYVKN	IIKKVNGQKF	VYKFVSYPEI	LNMDPMTVGR
IEGDCESLNF	SEVSSSSKDV	ENGGKDKPPQ	PGAKTSSRND	YIHSGLYSSF
TLNSLNSSNV	KLFKLIKTEN	PAEKLAEKKS	PQEPTPSVIK	FVTTPSKKPP
VEPVAATISI	GPSISPSSEE	TIQALETLVS	PKLPSLEAPT	SASNVMTAFA
TTPPISSIPP	LQEPPRTPSP	PLSSHPDIDT	DIDSVASQPM	ELPENLSLEP
KDQDSVLLEK	DKVNNSSRSK	KPKGLELAPT	LVITSSDPSP	LGILSPSLPT
ASLTPAFFSQ	TPIILTPSPL	LSSIHFWSTL	SPVAPLSPAR	LQGANTLFQF
PSVLNSHGPF	TLSGLDGPST	PGPFSPDLQK	T

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Dalton S., Treisman R. (1992). Characterization of SAP-1, a protein recruited by serum response factor to the c-fos serum response element. Cell. 68: 597—612. PMID 1339307 doi:10.1016/0092-8674(92)90194-H
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Mo Y., Vaessen B., Johnston K., Marmorstein R. (1998). Structures of SAP-1 bound to DNA targets from the E74 and c-fos promoters: insights into DNA sequence discrimination by Ets proteins. Mol. Cell. 2: 201—212. PMID 9734357 doi:10.1016/S1097-2765(00)80130-6
Dalton S., Treisman R. (1994). Characterization of SAP-1, a protein recruited by serum response factor to the c-fos serum response element. Cell. 76: 411—411. PMID 8293474

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3326 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P28324 (англ.) . Архів оригіналу за 22 жовтня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3326 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P28324 (англ.) . Архів оригіналу за 22 жовтня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]