EGR2

EGR2
Ідентифікатори
Символи EGR2, AT591, CMT1D, CMT4E, KROX20, early growth response 2, CHN1
Зовнішні ІД OMIM: 129010 MGI: 95296 HomoloGene: 20123 GeneCards: EGR2
Пов'язані генетичні захворювання
Charcot-Marie-Tooth disease type 4E, Charcot-Marie-Tooth disease type 1D[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1959
13654
Ensembl
ENSG00000122877
ENSMUSG00000037868
UniProt
P11161
P08152
RefSeq (мРНК)
NM_000399
NM_001136177
NM_001136178
NM_001136179
NM_001321037
NM_010118
NM_001347458
RefSeq (білок)
NP_000390
NP_001129649
NP_001129650
NP_001129651
NP_001307966
Локус (UCSC) Хр. 10: 62.81 – 62.82 Mb Хр. 10: 67.54 – 67.54 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

EGR2 (англ. Early growth response 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 476 амінокислот, а молекулярна маса — 50 302[5].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MMTAKAVDKI PVTLSGFVHQ LSDNIYPVED LAATSVTIFP NAELGGPFDQ
MNGVAGDGMI NIDMTGEKRS LDLPYPSSFA PVSAPRNQTF TYMGKFSIDP
QYPGASCYPE GIINIVSAGI LQGVTSPAST TASSSVTSAS PNPLATGPLG
VCTMSQTQPD LDHLYSPPPP PPPYSGCAGD LYQDPSAFLS AATTSTSSSL
AYPPPPSYPS PKPATDPGLF PMIPDYPGFF PSQCQRDLHG TAGPDRKPFP
CPLDTLRVPP PLTPLSTIRN FTLGGPSAGV TGPGASGGSE GPRLPGSSSA
AAAAAAAAAY NPHHLPLRPI LRPRKYPNRP SKTPVHERPY PCPAEGCDRR
FSRSDELTRH IRIHTGHKPF QCRICMRNFS RSDHLTTHIR THTGEKPFAC
DYCGRKFARS DERKRHTKIH LRQKERKSSA PSASVPAPST ASCSGGVQPG
GTLCSSNSSS LGGGPLAPCS SRTRTP

Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
  • Rangnekar V.M., Aplin A.C., Sukhatme V.P. (1990). The serum and TPA responsive promoter and intron-exon structure of EGR2, a human early growth response gene encoding a zinc finger protein. Nucleic Acids Res. 18: 2749—2757. PMID 2111009 doi:10.1093/nar/18.9.2749
  • Luciano R.L., Wilson A.C. (2003). HCF-1 functions as a coactivator for the zinc finger protein Krox20. J. Biol. Chem. 278: 51116—51124. PMID 14532282 doi:10.1074/jbc.M303470200
  • Garcia-Gutierrez P., Juarez-Vicente F., Gallardo-Chamizo F., Charnay P., Garcia-Dominguez M. (2011). The transcription factor Krox20 is an E3 ligase that sumoylates its Nab coregulators. EMBO Rep. 12: 1018—1023. PMID 21836637 doi:10.1038/embor.2011.152

Примітки

Див. також