| EGR2
|
|---|
 |
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| EGR2, AT591, CMT1D, CMT4E, KROX20, early growth response 2, CHN1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 129010 MGI: 95296 HomoloGene: 20123 GeneCards: EGR2
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| Charcot-Marie-Tooth disease type 4E, Charcot-Marie-Tooth disease type 1D[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • HMG box domain binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • зв’язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • ubiquitin protein ligase binding • transferase activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • SUMO ligase activity
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела
|
|---|
| Біологічний процес |
• cellular response to organic substance • rhythmic behavior • peripheral nervous system development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • rhombomere 3 development • brain segmentation • transcription by RNA polymerase II • protein sumoylation • rhombomere 3 formation • transcription, DNA-templated • response to insulin • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • brain development • rhombomere 5 formation • protein export from nucleus • learning or memory • skeletal muscle cell differentiation • Schwann cell differentiation • regulation of neuronal synaptic plasticity • myelination • facial nerve structural organization • regulation of ossification • motor neuron axon guidance • fat cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 10: 62.81 – 62.82 Mb
| Хр. 10: 67.54 – 67.54 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
EGR2 (англ. Early growth response 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 476 амінокислот, а молекулярна маса — 50 302[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MMTAKAVDKI
|
|
PVTLSGFVHQ
|
|
LSDNIYPVED
|
|
LAATSVTIFP
|
|
NAELGGPFDQ
|
| MNGVAGDGMI
|
|
NIDMTGEKRS
|
|
LDLPYPSSFA
|
|
PVSAPRNQTF
|
|
TYMGKFSIDP
|
| QYPGASCYPE
|
|
GIINIVSAGI
|
|
LQGVTSPAST
|
|
TASSSVTSAS
|
|
PNPLATGPLG
|
| VCTMSQTQPD
|
|
LDHLYSPPPP
|
|
PPPYSGCAGD
|
|
LYQDPSAFLS
|
|
AATTSTSSSL
|
| AYPPPPSYPS
|
|
PKPATDPGLF
|
|
PMIPDYPGFF
|
|
PSQCQRDLHG
|
|
TAGPDRKPFP
|
| CPLDTLRVPP
|
|
PLTPLSTIRN
|
|
FTLGGPSAGV
|
|
TGPGASGGSE
|
|
GPRLPGSSSA
|
| AAAAAAAAAY
|
|
NPHHLPLRPI
|
|
LRPRKYPNRP
|
|
SKTPVHERPY
|
|
PCPAEGCDRR
|
| FSRSDELTRH
|
|
IRIHTGHKPF
|
|
QCRICMRNFS
|
|
RSDHLTTHIR
|
|
THTGEKPFAC
|
| DYCGRKFARS
|
|
DERKRHTKIH
|
|
LRQKERKSSA
|
|
PSASVPAPST
|
|
ASCSGGVQPG
|
| GTLCSSNSSS
|
|
LGGGPLAPCS
|
|
SRTRTP
|
Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Rangnekar V.M., Aplin A.C., Sukhatme V.P. (1990). The serum and TPA responsive promoter and intron-exon structure of EGR2, a human early growth response gene encoding a zinc finger protein. Nucleic Acids Res. 18: 2749—2757. PMID 2111009 doi:10.1093/nar/18.9.2749
- Luciano R.L., Wilson A.C. (2003). HCF-1 functions as a coactivator for the zinc finger protein Krox20. J. Biol. Chem. 278: 51116—51124. PMID 14532282 doi:10.1074/jbc.M303470200
- Garcia-Gutierrez P., Juarez-Vicente F., Gallardo-Chamizo F., Charnay P., Garcia-Dominguez M. (2011). The transcription factor Krox20 is an E3 ligase that sumoylates its Nab coregulators. EMBO Rep. 12: 1018—1023. PMID 21836637 doi:10.1038/embor.2011.152
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|