| BCL11B
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| BCL11B, ATL1, ATL1-alpha, ATL1-beta, ATL1-delta, ATL1-gamma, CTIP-2, CTIP2, RIT1, ZNF856B, hRIT1-alpha, B-cell CLL/lymphoma 11B, IMD49, B cell CLL/lymphoma 11B, IDDFSTA, BAF complex component, BAF chromatin remodeling complex subunit SMARCM2 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 606558 MGI: 1929913 HomoloGene: 10974 GeneCards: BCL11B
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв’язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
|
|---|
| Клітинна компонента |
• внутрішньоклітинний • neuron projection • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• commitment of neuronal cell to specific neuron type in forebrain • regulation of neuron differentiation • Нейрогенез • olfactory bulb axon guidance • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • T cell differentiation in thymus • аксоноґенеза • epithelial cell morphogenesis • thymus development • T cell receptor V(D)J recombination • negative regulation of apoptotic process • transcription by RNA polymerase II • Післязародковий розвиток • positive T cell selection • transcription, DNA-templated • striatal medium spiny neuron differentiation • odontogenesis of dentin-containing tooth • regulation of lipid metabolic process • keratinocyte development • post-embryonic camera-type eye development • central nervous system neuron differentiation • регуляція експресії генів • alpha-beta T cell differentiation • regulation of keratinocyte proliferation • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of cell population proliferation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • skin development • hematopoietic stem cell migration • lymphoid lineage cell migration into thymus
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 14: 99.17 – 99.27 Mb
| Хр. 12: 107.88 – 107.97 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
BCL11B (англ. B-cell CLL/lymphoma 11B) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 894 амінокислот, а молекулярна маса — 95 519[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MSRRKQGNPQ
|
|
HLSQRELITP
|
|
EADHVEAAIL
|
|
EEDEGLEIEE
|
|
PSGLGLMVGG
|
| PDPDLLTCGQ
|
|
CQMNFPLGDI
|
|
LVFIEHKRKQ
|
|
CGGSLGACYD
|
|
KALDKDSPPP
|
| SSRSELRKVS
|
|
EPVEIGIQVT
|
|
PDEDDHLLSP
|
|
TKGICPKQEN
|
|
IAGPCRPAQL
|
| PAVAPIAASS
|
|
HPHSSVITSP
|
|
LRALGALPPC
|
|
LPLPCCSARP
|
|
VSGDGTQGEG
|
| QTEAPFGCQC
|
|
QLSGKDEPSS
|
|
YICTTCKQPF
|
|
NSAWFLLQHA
|
|
QNTHGFRIYL
|
| EPGPASSSLT
|
|
PRLTIPPPLG
|
|
PEAVAQSPLM
|
|
NFLGDSNPFN
|
|
LLRMTGPILR
|
| DHPGFGEGRL
|
|
PGTPPLFSPP
|
|
PRHHLDPHRL
|
|
SAEEMGLVAQ
|
|
HPSAFDRVMR
|
| LNPMAIDSPA
|
|
MDFSRRLREL
|
|
AGNSSTPPPV
|
|
SPGRGNPMHR
|
|
LLNPFQPSPK
|
| SPFLSTPPLP
|
|
PMPPGGTPPP
|
|
QPPAKSKSCE
|
|
FCGKTFKFQS
|
|
NLIVHRRSHT
|
| GEKPYKCQLC
|
|
DHACSQASKL
|
|
KRHMKTHMHK
|
|
AGSLAGRSDD
|
|
GLSAASSPEP
|
| GTSELAGEGL
|
|
KAADGDFRHH
|
|
ESDPSLGHEP
|
|
EEEDEEEEEE
|
|
EEELLLENES
|
| RPESSFSMDS
|
|
ELSRNRENGG
|
|
GGVPGVPGAG
|
|
GGAAKALADE
|
|
KALVLGKVME
|
| NVGLGALPQY
|
|
GELLADKQKR
|
|
GAFLKRAAGG
|
|
GDAGDDDDAG
|
|
GCGDAGAGGA
|
| VNGRGGGFAP
|
|
GTEPFPGLFP
|
|
RKPAPLPSPG
|
|
LNSAAKRIKV
|
|
EKDLELPPAA
|
| LIPSENVYSQ
|
|
WLVGYAASRH
|
|
FMKDPFLGFT
|
|
DARQSPFATS
|
|
SEHSSENGSL
|
| RFSTPPGDLL
|
|
DGGLSGRSGT
|
|
ASGGSTPHLG
|
|
GPGPGRPSSK
|
|
EGRRSDTCEY
|
| CGKVFKNCSN
|
|
LTVHRRSHTG
|
|
ERPYKCELCN
|
|
YACAQSSKLT
|
|
RHMKTHGQIG
|
| KEVYRCDICQ
|
|
MPFSVYSTLE
|
|
KHMKKWHGEH
|
|
LLTNDVKIEQ
|
|
AERS
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|