| HEY2
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| HEY2, CHF1, GRIDLOCK, GRL, HERP1, HESR2, HRT2, bHLHb32, hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif 2 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 604674 MGI: 1341884 HomoloGene: 22705 GeneCards: HEY2
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• microsatellite binding • sequence-specific DNA binding • DNA binding • protein dimerization activity • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • histone deacetylase binding • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001106 transcription corepressor activity • sequence-specific double-stranded DNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • transcription repressor complex • Sin3 complex • нуклеоплазма • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• dorsal aorta morphogenesis • cardiac vascular smooth muscle cell development • cochlea development • pattern specification process • cell fate commitment • pulmonary valve morphogenesis • regulation of inner ear auditory receptor cell differentiation • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in smooth muscle cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • heart trabecula formation • tricuspid valve morphogenesis • regulation of vasculogenesis • pulmonary artery morphogenesis • cardiac septum morphogenesis • negative regulation of cardiac vascular smooth muscle cell differentiation • muscular septum morphogenesis • ventricular septum morphogenesis • protein-DNA complex assembly • cardiac muscle hypertrophy • outflow tract morphogenesis • ascending aorta morphogenesis • cardiac left ventricle morphogenesis • labyrinthine layer blood vessel development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • coronary vasculature morphogenesis • smooth muscle cell differentiation • negative regulation of gene expression • endocardial cushion to mesenchymal transition involved in heart valve formation • transcription, DNA-templated • ventricular trabecula myocardium morphogenesis • positive regulation of heart rate • васкулогенез • multicellular organism development • atrial septum morphogenesis • negative regulation of cardiac muscle cell apoptotic process • development of the heart • arterial endothelial cell differentiation • positive regulation of cardiac muscle cell proliferation • blood vessel development • cardiac muscle hypertrophy in response to stress • umbilical cord morphogenesis • negative regulation of transcription regulatory region DNA binding • mesenchymal cell development • artery development • регуляція експресії генів • negative regulation of transcription by transcription factor localization • negative regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter • vascular associated smooth muscle cell development • anterior/posterior axis specification • tricuspid valve formation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • cardiac ventricle morphogenesis • cardiac right ventricle morphogenesis • ventricular cardiac muscle cell development • atrioventricular valve development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of Notch signaling pathway • cardiac epithelial to mesenchymal transition • Notch signaling involved in heart development • Сигнальний шлях Notch • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • диференціація клітин • regulation of neurogenesis • aortic valve morphogenesis • epithelial to mesenchymal transition involved in endocardial cushion formation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of biomineral tissue development • anterior/posterior pattern specification • circulatory system development
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 6: 125.75 – 125.76 Mb
| Хр. 10: 30.71 – 30.72 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
HEY2 (англ. Hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 337 амінокислот, а молекулярна маса — 35 808[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MKRPCEETTS
|
|
ESDMDETIDV
|
|
GSENNYSGQS
|
|
TSSVIRLNSP
|
|
TTTSQIMARK
|
| KRRGIIEKRR
|
|
RDRINNSLSE
|
|
LRRLVPTAFE
|
|
KQGSAKLEKA
|
|
EILQMTVDHL
|
| KMLQATGGKG
|
|
YFDAHALAMD
|
|
FMSIGFRECL
|
|
TEVARYLSSV
|
|
EGLDSSDPLR
|
| VRLVSHLSTC
|
|
ATQREAAAMT
|
|
SSMAHHHHPL
|
|
HPHHWAAAFH
|
|
HLPAALLQPN
|
| GLHASESTPC
|
|
RLSTTSEVPP
|
|
AHGSALLTAT
|
|
FAHADSALRM
|
|
PSTGSVAPCV
|
| PPLSTSLLSL
|
|
SATVHAAAAA
|
|
ATAAAHSFPL
|
|
SFAGAFPMLP
|
|
PNAAAAVAAA
|
| TAISPPLSVS
|
|
ATSSPQQTSS
|
|
GTNNKPYRPW
|
|
GTEVGAF
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Leimeister C., Externbrinck A., Klamt B., Gessler M. (1999). Hey genes: a novel subfamily of hairy- and enhancer of split related genes specifically expressed during mouse embryogenesis. Mech. Dev. 85: 173—177. PMID 10415358 doi:10.1016/S0925-4773(99)00080-5
- Zhong T.P., Rosenberg M., Mohideen M.-A.P.K., Weinstein B., Fishman M.C. (2000). Gridlock, an HLH gene required for assembly of the aorta in zebrafish. Science. 287: 1820—1824. PMID 10710309 doi:10.1126/science.287.5459.1820
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Shirvani S., Xiang F., Koibuchi N., Chin M.T. (2006). CHF1/Hey2 suppresses SM-MHC promoter activity through an interaction with GATA-6. Biochem. Biophys. Res. Commun. 339: 151—156. PMID 16293227 doi:10.1016/j.bbrc.2005.10.190
- Reamon-Buettner S.M., Borlak J. (2006). HEY2 mutations in malformed hearts. Hum. Mutat. 27: 118—118. PMID 16329098 doi:10.1002/humu.9390
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|