| KLF4
|
|---|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| KLF4, EZF, GKLF, Kruppel-like factor 4 (gut), Kruppel like factor 4 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 602253 MGI: 1342287 HomoloGene: 3123 GeneCards: KLF4
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • beta-catenin binding • phosphatidylinositol 3-kinase regulator activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • зв’язування з іоном металу • RNA polymerase II sequence-specific DNA-binding transcription factor recruiting activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • зв’язування дволанцюгових ДНК • promoter-specific chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription coregulator binding • histone deacetylase binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • transcription regulator complex • нуклеоплазма • хроматин • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• negative regulation of chemokine (C-X-C motif) ligand 2 production • epidermal cell differentiation • cellular response to retinoic acid • negative regulation of protein kinase B signaling • negative regulation of muscle hyperplasia • negative regulation of smooth muscle cell proliferation • GO:0051247, GO:0051200 positive regulation of protein metabolic process • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • regulation of axon regeneration • cellular response to peptide • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of hemoglobin biosynthetic process • response to retinoic acid • somatic stem cell population maintenance • cellular response to laminar fluid shear stress • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин • epidermis morphogenesis • positive regulation of nitric oxide biosynthetic process • cellular response to growth factor stimulus • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • post-embryonic hemopoiesis • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • відгук на органічну речовину • negative regulation of gene expression • negative regulation of response to cytokine stimulus • transcription, DNA-templated • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • negative regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • stem cell population maintenance • negative regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of cell migration • regulation of cell population proliferation • post-embryonic camera-type eye development • regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity • positive regulation of telomerase activity • canonical Wnt signaling pathway • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • регуляція диференціювання клітин • mesodermal cell fate determination • negative regulation of heterotypic cell-cell adhesion • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • cellular response to cycloheximide • negative regulation of inflammatory response • fat cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell population proliferation • cellular response to hydrogen peroxide • negative regulation of leukocyte adhesion to arterial endothelial cell • positive regulation of core promoter binding • cellular response to leukemia inhibitory factor • negative regulation of angiogenesis • pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • positive regulation of sprouting angiogenesis
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 9: 107.48 – 107.49 Mb
| Хр. 4: 55.53 – 55.53 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
KLF4 (англ. Kruppel like factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 513 амінокислот, а молекулярна маса — 54 671[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MRQPPGESDM
|
|
AVSDALLPSF
|
|
STFASGPAGR
|
|
EKTLRQAGAP
|
|
NNRWREELSH
|
| MKRLPPVLPG
|
|
RPYDLAAATV
|
|
ATDLESGGAG
|
|
AACGGSNLAP
|
|
LPRRETEEFN
|
| DLLDLDFILS
|
|
NSLTHPPESV
|
|
AATVSSSASA
|
|
SSSSSPSSSG
|
|
PASAPSTCSF
|
| TYPIRAGNDP
|
|
GVAPGGTGGG
|
|
LLYGRESAPP
|
|
PTAPFNLADI
|
|
NDVSPSGGFV
|
| AELLRPELDP
|
|
VYIPPQQPQP
|
|
PGGGLMGKFV
|
|
LKASLSAPGS
|
|
EYGSPSVISV
|
| SKGSPDGSHP
|
|
VVVAPYNGGP
|
|
PRTCPKIKQE
|
|
AVSSCTHLGA
|
|
GPPLSNGHRP
|
| AAHDFPLGRQ
|
|
LPSRTTPTLG
|
|
LEEVLSSRDC
|
|
HPALPLPPGF
|
|
HPHPGPNYPS
|
| FLPDQMQPQV
|
|
PPLHYQGQSR
|
|
GFVARAGEPC
|
|
VCWPHFGTHG
|
|
MMLTPPSSPL
|
| ELMPPGSCMP
|
|
EEPKPKRGRR
|
|
SWPRKRTATH
|
|
TCDYAGCGKT
|
|
YTKSSHLKAH
|
| LRTHTGEKPY
|
|
HCDWDGCGWK
|
|
FARSDELTRH
|
|
YRKHTGHRPF
|
|
QCQKCDRAFS
|
| RSDHLALHMK
|
|
RHF
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Wei X., Xu H., Kufe D. (2007). Human mucin 1 oncoprotein represses transcription of the p53 tumor suppressor gene. Cancer Res. 67: 1853—1858. PMID 17308127 doi:10.1158/0008-5472.CAN-06-3063
- Zhang P., Andrianakos R., Yang Y., Liu C., Lu W. (2010). Kruppel-like factor 4 (Klf4) prevents embryonic stem (ES) cell differentiation by regulating Nanog gene expression. J. Biol. Chem. 285: 9180—9189. PMID 20071344 doi:10.1074/jbc.M109.077958
- Bjerke G.A., Hyman-Walsh C., Wotton D. (2011). Cooperative transcriptional activation by Klf4, Meis2, and Pbx1. Mol. Cell. Biol. 31: 3723—3733. PMID 21746878 doi:10.1128/MCB.01456-10
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|