| FOXK1
|
|---|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| FOXK1, FOXK1L, forkhead box K1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 616302 MGI: 1347488 HomoloGene: 82414 GeneCards: FOXK1
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • multicellular organism development • muscle organ development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • protein deubiquitination • anatomical structure morphogenesis • диференціація клітин • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 7: 4.68 – 4.77 Mb
| Хр. 5: 142.39 – 142.45 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
FOXK1 (англ. Forkhead box K1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 733 амінокислот, а молекулярна маса — 75 457[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MAEVGEDSGA
|
|
RALLALRSAP
|
|
CSPVLCAAAA
|
|
AAAFPAAAPP
|
|
PAPAQPQPPP
|
| GPPPPPPPPL
|
|
PPGAIAGAGS
|
|
SGGSSGVSGD
|
|
SAVAGAAPAL
|
|
VAAAAASVRQ
|
| SPGPALARLE
|
|
GREFEFLMRQ
|
|
PSVTIGRNSS
|
|
QGSVDLSMGL
|
|
SSFISRRHLQ
|
| LSFQEPHFYL
|
|
RCLGKNGVFV
|
|
DGAFQRRGAP
|
|
ALQLPKQCTF
|
|
RFPSTAIKIQ
|
| FTSLYHKEEA
|
|
PASPLRPLYP
|
|
QISPLKIHIP
|
|
EPDLRSMVSP
|
|
VPSPTGTISV
|
| PNSCPASPRG
|
|
AGSSSYRFVQ
|
|
NVTSDLQLAA
|
|
EFAAKAASEQ
|
|
QADTSGGDSP
|
| KDESKPPFSY
|
|
AQLIVQAISS
|
|
AQDRQLTLSG
|
|
IYAHITKHYP
|
|
YYRTADKGWQ
|
| NSIRHNLSLN
|
|
RYFIKVPRSQ
|
|
EEPGKGSFWR
|
|
IDPASEAKLV
|
|
EQAFRKRRQR
|
| GVSCFRTPFG
|
|
PLSSRSAPAS
|
|
PTHPGLMSPR
|
|
SGGLQTPECL
|
|
SREGSPIPHD
|
| PEFGSKLASV
|
|
PEYRYSQSAP
|
|
GSPVSAQPVI
|
|
MAVPPRPSSL
|
|
VAKPVAYMPA
|
| SIVTSQQPAG
|
|
HAIHVVQQAP
|
|
TVTMVRVVTT
|
|
SANSANGYIL
|
|
TSQGAAGGSH
|
| DAAGAAVLDL
|
|
GSEARGLEEK
|
|
PTIAFATIPA
|
|
AGGVIQTVAS
|
|
QMAPGVPGHT
|
| VTILQPATPV
|
|
TLGQHHLPVR
|
|
AVTQNGKHAV
|
|
PTNSLAGNAY
|
|
ALTSPLQLLA
|
| TQASSSAPVV
|
|
VTRVCEVGPK
|
|
EPAAAVAATA
|
|
TTTPATATTA
|
|
SASASSTGEP
|
| EVKRSRVEEP
|
|
SGAVTTPAGV
|
|
IAAAGPQGPG
|
|
TGE
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, міогенез, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Katoh M., Katoh M. (2004). Identification and characterization of human FOXK1 gene in silico. Int. J. Mol. Med. 14: 127—132. PMID 15202027
- Huang J.T., Lee V. (2004). Identification and characterization of a novel human FOXK1 gene in silico. Int. J. Oncol. 25: 751—757. PMID 15289879
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|