GATA5

GATA5
Ідентифікатори
Символи	GATA5, GATAS, bB379O24.1, GATA binding protein 5, CHTD5
Зовнішні ІД	OMIM: 611496 MGI: 109497 HomoloGene: 32031 GeneCards: GATA5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • zinc ion binding; • chromatin binding; • зв’язування з іоном металу; • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• transcription regulator complex; • нуклеоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • cellular response to BMP stimulus; • зсідання крові; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • intestinal epithelial cell differentiation; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • aortic valve morphogenesis; • endocardial cushion fusion; • negative regulation of cardiac muscle hypertrophy; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • negative regulation of gene expression; • positive regulation of Notch signaling pathway involved in heart induction; • positive regulation of cardiac endothelial to mesenchymal transition; • development of the heart; • animal organ morphogenesis; • гістогенез; • розвиток клітин; • anatomical structure formation involved in morphogenesis; • digestive tract development; • cardiac muscle tissue development; • circulatory system development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	140628
	14464
	ENSG00000130700
	ENSMUSG00000015627
	Q9BWX5
	P97489
	NM_080473
	NM_008093
	NP_536721
	NP_032119
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GATA5 (англ. GATA binding protein 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 397 амінокислот, а молекулярна маса — 41 299^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYQSLALAAS	PRQAAYADSG	SFLHAPGAGS	PMFVPPARVP	SMLSYLSGCE
PSPQPPELAA	RPGWAQTATA	DSSAFGPGSP	HPPAAHPPGA	TAFPFAHSPS
GPGSGGSAGG	RDGSAYQGAL	LPREQFAAPL	GRPVGTSYSA	TYPAYVSPDV
AQSWTAGPFD	GSVLHGLPGR	RPTFVSDFLE	EFPGEGRECV	NCGALSTPLW
RRDGTGHYLC	NACGLYHKMN	GVNRPLVRPQ	KRLSSSRRAG	LCCTNCHTTN
TTLWRRNSEG	EPVCNACGLY	MKLHGVPRPL	AMKKESIQTR	KRKPKTIAKA
RGSSGSTRNA	SASPSAVAST	DSSAATSKAK	PSLASPVCPG	PSMAPQASGQ
EDDSLAPGHL	EFKFEPEDFA	FPSTAPSPQA	GLRGALRQEA	WCALALA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Gu J.Y., Xu J.H., Yu H., Yang Y.Q. (2012). Novel GATA5 loss-of-function mutations underlie familial atrial fibrillation. Clinics (Sao Paulo). 67: 1393—1399. PMID 23295592 doi:10.6061/clinics/2012(12)08
Padang R., Bagnall R.D., Richmond D.R., Bannon P.G., Semsarian C. (2012). Rare non-synonymous variations in the transcriptional activation domains of GATA5 in bicuspid aortic valve disease. J. Mol. Cell. Cardiol. 53: 277—281. PMID 22641149 doi:10.1016/j.yjmcc.2012.05.009
Huang R.T., Xue S., Xu Y.J., Zhou M., Yang Y.Q. (2014). Somatic GATA5 mutations in sporadic tetralogy of Fallot. Int. J. Mol. Med. 33: 1227—1235. PMID 24573614 doi:10.3892/ijmm.2014.1674

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15802 (англ.) . Архів оригіналу за 28 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-06-28 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9BWX5 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15802 (англ.) . Архів оригіналу за 28 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-06-28 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q9BWX5 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]