NR4A1

NR4A1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2QW4, 3V3E, 3V3Q, 4JGV, 4KZI, 4KZJ, 4KZM, 4RZE, 4RZF, 4RZG, 4RE8, 4REE, 4REF, 4WHF, 4WHG
Ідентифікатори
Символи	NR4A1, GFRP1, HMR, N10, NAK-1, NGFIB, NP10, NUR77, TR3, nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, NH41
Зовнішні ІД	OMIM: 139139 MGI: 1352454 HomoloGene: 1612 GeneCards: NR4A1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • zinc ion binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • зв’язування з іоном металу; • steroid hormone receptor activity; • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein heterodimerization activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • glucocorticoid receptor binding;
Клітинна компонента	• ядерна мембрана; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • цитоплазма; • гіалоплазма; • transcription regulator complex;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of endothelial cell proliferation; • negative regulation of cell cycle; • cellular response to fibroblast growth factor stimulus; • transcription, DNA-templated; • cell migration involved in sprouting angiogenesis; • endothelial cell chemotaxis; • cellular response to corticotropin-releasing hormone stimulus; • cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • fat cell differentiation; • regulation of type B pancreatic cell proliferation; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • steroid hormone mediated signaling pathway; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • intracellular receptor signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3164
	15370
	ENSG00000123358
	ENSMUSG00000023034
	P22736
	P12813
	NM_001202233; NM_001202234; NM_002135; NM_173157; NM_173158
	NM_010444
NP_001189162; NP_001189163; NP_002126; NP_775180; NP_002126.2;
	NP_775180.1
	NP_034574
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NR4A1 (англ. Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 598 амінокислот, а молекулярна маса — 64 463^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPCIQAQYGT	PAPSPGPRDH	LASDPLTPEF	IKPTMDLASP	EAAPAAPTAL
PSFSTFMDGY	TGEFDTFLYQ	LPGTVQPCSS	ASSSASSTSS	SSATSPASAS
FKFEDFQVYG	CYPGPLSGPV	DEALSSSGSD	YYGSPCSAPS	PSTPSFQPPQ
LSPWDGSFGH	FSPSQTYEGL	RAWTEQLPKA	SGPPQPPAFF	SFSPPTGPSP
SLAQSPLKLF	PSQATHQLGE	GESYSMPTAF	PGLAPTSPHL	EGSGILDTPV
TSTKARSGAP	GGSEGRCAVC	GDNASCQHYG	VRTCEGCKGF	FKRTVQKNAK
YICLANKDCP	VDKRRRNRCQ	FCRFQKCLAV	GMVKEVVRTD	SLKGRRGRLP
SKPKQPPDAS	PANLLTSLVR	AHLDSGPSTA	KLDYSKFQEL	VLPHFGKEDA
GDVQQFYDLL	SGSLEVIRKW	AEKIPGFAEL	SPADQDLLLE	SAFLELFILR
LAYRSKPGEG	KLIFCSGLVL	HRLQCARGFG	DWIDSILAFS	RSLHSLLVDV
PAFACLSALV	LITDRHGLQE	PRRVEELQNR	IASCLKEHVA	AVAGEPQPAS
CLSRLLGKLP	ELRTLCTQGL	QRIFYLKLED	LVPPPPIIDK	IFMDTLPF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Nakai A., Kartha S., Sakurai A., Toback F.G., Degroot L.J. (1990). A human early response gene homologous to murine nur77 and rat NGFI-B, and related to the nuclear receptor superfamily. Mol. Endocrinol. 4: 1438—1443. PMID 2283997 doi:10.1210/mend-4-10-1438
Chang C., Kokontis J., Liao S., Chang Y. (1989). Isolation and characterization of human TR3 receptor: a member of steroid receptor superfamily. J. Steroid Biochem. 34: 391—395. PMID 2626032 doi:10.1016/0022-4731(89)90114-3
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Harant H., Lindley I.J. (2004). Negative cross-talk between the human orphan nuclear receptor Nur77/NAK-1/TR3 and nuclear factor-kappaB. Nucleic Acids Res. 32: 5280—5290. PMID 15466594 doi:10.1093/nar/gkh856
Bondy G.P. (1991). Phorbol ester, forskolin, and serum induction of a human colon nuclear hormone receptor gene related to the NUR 77/NGFI-B genes. Cell Growth Differ. 2: 203—208. PMID 1651101

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7980 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-23 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P22736 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7980 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-23 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P22736 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]