| IRX6
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| IRX6, IRX-3, IRX7, IRXB3, iroquois homeobox 6 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 606196 MGI: 1927642 HomoloGene: 41481 GeneCards: IRX6
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 16: 55.32 – 55.33 Mb
| Хр. 8: 93.4 – 93.41 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
IRX6 (англ. Iroquois homeobox 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 446 амінокислот, а молекулярна маса — 48 240[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MSFPHFGHPY
|
|
RGASQFLASA
|
|
SSSTTCCEST
|
|
QRSVSDVASG
|
|
STPAPALCCA
|
| PYDSRLLGSA
|
|
RPELGAALGI
|
|
YGAPYAAAAA
|
|
AQSYPGYLPY
|
|
SPEPPSLYGA
|
| LNPQYEFKEA
|
|
AGSFTSSLAQ
|
|
PGAYYPYERT
|
|
LGQYQYERYG
|
|
AVELSGAGRR
|
| KNATRETTST
|
|
LKAWLNEHRK
|
|
NPYPTKGEKI
|
|
MLAIITKMTL
|
|
TQVSTWFANA
|
| RRRLKKENKM
|
|
TWAPKNKGGE
|
|
ERKAEGGEED
|
|
SLGCLTADTK
|
|
EVTASQEARG
|
| LRLSDLEDLE
|
|
EEEEEEEEAE
|
|
DEEVVATAGD
|
|
RLTEFRKGAQ
|
|
SLPGPCAAAR
|
| EGRLERRECG
|
|
LAAPRFSFND
|
|
PSGSEEADFL
|
|
SAETGSPRLT
|
|
MHYPCLEKPR
|
| IWSLAHTATA
|
|
SAVEGAPPAR
|
|
PRPRSPECRM
|
|
IPGQPPASAR
|
|
RLSVPRDSAC
|
| DESSCIPKAF
|
|
GNPKFALQGL
|
|
PLNCAPCPRR
|
|
SEPVVQCQYP
|
|
SGAEAG
|
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|