| HOXC13
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| HOXC13, ECTD9, HOX3, HOX3G, homeobox C13 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 142976 MGI: 99560 HomoloGene: 7770 GeneCards: HOXC13
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| pure hair-nail type ectodermal dysplasia[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• hair follicle development • multicellular organism development • nail development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • anterior/posterior pattern specification • tongue morphogenesis • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • anatomical structure morphogenesis
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 12: 53.94 – 53.95 Mb
| Хр. 15: 102.83 – 102.84 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
HOXC13 (англ. Homeobox C13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 330 амінокислот, а молекулярна маса — 35 379[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MTTSLLLHPR
|
|
WPESLMYVYE
|
|
DSAAESGIGG
|
|
GGGGGGGGTG
|
|
GAGGGCSGAS
|
| PGKAPSMDGL
|
|
GSSCPASHCR
|
|
DLLPHPVLGR
|
|
PPAPLGAPQG
|
|
AVYTDIPAPE
|
| AARQCAPPPA
|
|
PPTSSSATLG
|
|
YGYPFGGSYY
|
|
GCRLSHNVNL
|
|
QQKPCAYHPG
|
| DKYPEPSGAL
|
|
PGDDLSSRAK
|
|
EFAFYPSFAS
|
|
SYQAMPGYLD
|
|
VSVVPGISGH
|
| PEPRHDALIP
|
|
VEGYQHWALS
|
|
NGWDSQVYCS
|
|
KEQSQSAHLW
|
|
KSPFPDVVPL
|
| QPEVSSYRRG
|
|
RKKRVPYTKV
|
|
QLKELEKEYA
|
|
ASKFITKEKR
|
|
RRISATTNLS
|
| ERQVTIWFQN
|
|
RRVKEKKVVS
|
|
KSKAPHLHST
|
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|