NR1D2

NR1D2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4N73, 2V0V, 2V7C, 3CQV
Ідентифікатори
Символи	NR1D2, BD73, EAR-1R, RVR, nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, REVERBB, REVERBbeta
Зовнішні ІД	OMIM: 602304 MGI: 2449205 HomoloGene: 3763 GeneCards: NR1D2
Реагує на сполуку
	SR-9009, SR-9011
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • zinc ion binding; • зв’язування з іоном металу; • steroid hormone receptor activity; • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity; • core promoter sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • transcription factor binding; • nuclear receptor coactivator activity; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма; • RNA polymerase II transcription regulator complex; • цитоплазма;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of skeletal muscle cell differentiation; • ритмічний процес; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • regulation of lipid metabolic process; • regulation of circadian rhythm; • regulation of inflammatory response; • lipid homeostasis; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • steroid hormone mediated signaling pathway; • intracellular receptor signaling pathway; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • energy homeostasis; • multicellular organism development; • hormone-mediated signaling pathway; • диференціація клітин; • response to lipid; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • circadian behavior; • negative regulation of inflammatory response;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	9975
	353187
	ENSG00000174738
	ENSMUSG00000021775
	Q14995; Q6NSM0
	Q60674
	NM_001145425; NM_005126
	NM_011584
	NP_001138897; NP_005117
	NP_035714
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NR1D2 (англ. Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 579 амінокислот, а молекулярна маса — 64 625^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEVNAGGVIA	YISSSSSASS	PASCHSEGSE	NSFQSSSSSV	PSSPNSSNSD
TNGNPKNGDL	ANIEGILKND	RIDCSMKTSK	SSAPGMTKSH	SGVTKFSGMV
LLCKVCGDVA	SGFHYGVHAC	EGCKGFFRRS	IQQNIQYKKC	LKNENCSIMR
MNRNRCQQCR	FKKCLSVGMS	RDAVRFGRIP	KREKQRMLIE	MQSAMKTMMN
SQFSGHLQND	TLVEHHEQTA	LPAQEQLRPK	PQLEQENIKS	SSPPSSDFAK
EEVIGMVTRA	HKDTFMYNQE	QQENSAESMQ	PQRGERIPKN	MEQYNLNHDH
CGNGLSSHFP	CSESQQHLNG	QFKGRNIMHY	PNGHAICIAN	GHCMNFSNAY
TQRVCDRVPI	DGFSQNENKN	SYLCNTGGRM	HLVCPLSKSP	YVDPHKSGHE
IWEEFSMSFT	PAVKEVVEFA	KRIPGFRDLS	QHDQVNLLKA	GTFEVLMVRF
ASLFDAKERT	VTFLSGKKYS	VDDLHSMGAG	DLLNSMFEFS	EKLNALQLSD
EEMSLFTAVV	LVSADRSGIE	NVNSVEALQE	TLIRALRTLI	MKNHPNEASI
FTKLLLKLPD	LRSLNNMHSE	ELLAFKVHP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рецепторів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза, ДНК, гемом. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Gupta N., Ragsdale S.W. (2011). Thiol-disulfide redox dependence of heme binding and heme ligand switching in nuclear hormone receptor rev-erb{beta}. J. Biol. Chem. 286: 4392—4403. PMID 21123168 doi:10.1074/jbc.M110.193466
Stratmann M., Schibler U. (2012). REV-ERBs: more than the sum of the individual parts. Cell Metab. 15: 791—793. PMID 22682217 doi:10.1016/j.cmet.2012.05.006
Ripperger J.A., Albrecht U. (2012). REV-ERB-erating nuclear receptor functions in circadian metabolism and physiology. Cell Res. 22: 1319—1321. PMID 22613952 doi:10.1038/cr.2012.81

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7963 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q14995 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7963 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q14995 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]