| TFAP2E
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| TFAP2E, AP2E, transcription factor AP-2 epsilon, AP-2epsilon |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 614428 MGI: 2679630 HomoloGene: 2422 GeneCards: TFAP2E
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • protein homodimerization activity • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of cell population proliferation • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1903374 anatomical structure development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 1: 35.57 – 35.6 Mb
| Хр. 4: 126.61 – 126.63 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
TFAP2E (англ. Transcription factor AP-2 epsilon) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 442 амінокислот, а молекулярна маса — 46 212[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MLVHTYSAME
|
|
RPDGLGAAAG
|
|
GARLSSLPQA
|
|
AYGPAPPLCH
|
|
TPAATAAAEF
|
| QPPYFPPPYP
|
|
QPPLPYGQAP
|
|
DAAAAFPHLA
|
|
GDPYGGLAPL
|
|
AQPQPPQAAW
|
| AAPRAAARAH
|
|
EEPPGLLAPP
|
|
ARALGLDPRR
|
|
DYATAVPRLL
|
|
HGLADGAHGL
|
| ADAPLGLPGL
|
|
AAAPGLEDLQ
|
|
AMDEPGMSLL
|
|
DQSVIKKVPI
|
|
PSKASSLSAL
|
| SLAKDSLVGG
|
|
ITNPGEVFCS
|
|
VPGRLSLLSS
|
|
TSKYKVTVGE
|
|
VQRRLSPPEC
|
| LNASLLGGVL
|
|
RRAKSKNGGR
|
|
CLRERLEKIG
|
|
LNLPAGRRKA
|
|
ANVTLLTSLV
|
| EGEAVHLARD
|
|
FGYVCETEFP
|
|
AKAAAEYLCR
|
|
QHADPGELHS
|
|
RKSMLLAAKQ
|
| ICKEFADLMA
|
|
QDRSPLGNSR
|
|
PALILEPGVQ
|
|
SCLTHFSLIT
|
|
HGFGGPAICA
|
| ALTAFQNYLL
|
|
ESLKGLDKMF
|
|
LSSVGSGHGE
|
|
TKASEKDAKH
|
|
RK
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Tummala R., Romano R.-A., Fuchs E., Sinha S. (2003). Molecular cloning and characterization of AP-2 epsilon, a fifth member of the AP-2 family. Gene. 321: 93—102. PMID 14636996 doi:10.1016/S0378-1119(03)00840-0
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|