| TBX21
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| TBX21, T-PET, T-bet, TBET, TBLYM, T-box 21, T-box transcription factor 21, IMD88 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 604895 MGI: 1888984 HomoloGene: 8353 GeneCards: TBX21
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| aspirin-exacerbated respiratory disease[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• soma • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • cellular response to organic substance • positive regulation of isotype switching to IgG isotypes • response to virus • T cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • lymphocyte migration • transcription, DNA-templated • regulation of immune response • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of interleukin-2 production • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of T cell differentiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of T-helper 17 cell differentiation • negative regulation of T-helper 17 cell lineage commitment • negative regulation of T-helper 2 cell cytokine production • GO:1901313 positive regulation of gene expression
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 17: 47.73 – 47.75 Mb
| Хр. 11: 96.99 – 97.01 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
TBX21 (англ. T-box 21) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 535 амінокислот, а молекулярна маса — 58 328[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MGIVEPGCGD
|
|
MLTGTEPMPG
|
|
SDEGRAPGAD
|
|
PQHRYFYPEP
|
|
GAQDADERRG
|
| GGSLGSPYPG
|
|
GALVPAPPSR
|
|
FLGAYAYPPR
|
|
PQAAGFPGAG
|
|
ESFPPPADAE
|
| GYQPGEGYAA
|
|
PDPRAGLYPG
|
|
PREDYALPAG
|
|
LEVSGKLRVA
|
|
LNNHLLWSKF
|
| NQHQTEMIIT
|
|
KQGRRMFPFL
|
|
SFTVAGLEPT
|
|
SHYRMFVDVV
|
|
LVDQHHWRYQ
|
| SGKWVQCGKA
|
|
EGSMPGNRLY
|
|
VHPDSPNTGA
|
|
HWMRQEVSFG
|
|
KLKLTNNKGA
|
| SNNVTQMIVL
|
|
QSLHKYQPRL
|
|
HIVEVNDGEP
|
|
EAACNASNTH
|
|
IFTFQETQFI
|
| AVTAYQNAEI
|
|
TQLKIDNNPF
|
|
AKGFRENFES
|
|
MYTSVDTSIP
|
|
SPPGPNCQFL
|
| GGDHYSPLLP
|
|
NQYPVPSRFY
|
|
PDLPGQAKDV
|
|
VPQAYWLGAP
|
|
RDHSYEAEFR
|
| AVSMKPAFLP
|
|
SAPGPTMSYY
|
|
RGQEVLAPGA
|
|
GWPVAPQYPP
|
|
KMGPASWFRP
|
| MRTLPMEPGP
|
|
GGSEGRGPED
|
|
QGPPLVWTEI
|
|
APIRPESSDS
|
|
GLGEGDSKRR
|
| RVSPYPSSGD
|
|
SSSPAGAPSP
|
|
FDKEAEGQFY
|
|
NYFPN
|
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|