| FOXC2
|
|---|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| FOXC2, FKHL14, LD, MFH-1, MFH1, forkhead box C2 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 602402 MGI: 1347481 HomoloGene: 21091 GeneCards: FOXC2
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| Lymphedema–distichiasis syndrome[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • chromatin DNA binding • promoter-specific chromatin binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця
|
|---|
| Біологічний процес |
• Сигнальний шлях Notch • somitogenesis • embryonic skeletal system morphogenesis • skeletal system development • GO:1901047 insulin receptor signaling pathway • ureteric bud development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis • neural crest cell development • paraxial mesoderm formation • paraxial mesodermal cell fate commitment • осифікація • lymphangiogenesis • collagen fibril organization • розвиток нирки • glomerular mesangial cell development • heart morphogenesis • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • cardiac muscle cell proliferation • lymph vessel development • transcription, DNA-templated • embryonic heart tube development • positive regulation of endothelial cell migration • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • multicellular organism development • ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis • development of the heart • blood vessel remodeling • vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • blood vessel development • positive regulation of vascular wound healing • artery morphogenesis • branching involved in blood vessel morphogenesis • glomerular visceral epithelial cell differentiation • response to hormone • embryonic viscerocranium morphogenesis • embryonic cranial skeleton morphogenesis • camera-type eye development • glomerular endothelium development • positive regulation of cell adhesion mediated by integrin • mesoderm development • regulation of organ growth • metanephros development • проліферація • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of apoptotic process involved in outflow tract morphogenesis • transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • anatomical structure morphogenesis • negative regulation of cold-induced thermogenesis
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 16: 86.57 – 86.57 Mb
| Хр. 8: 121.84 – 121.85 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
FOXC2 (англ. Forkhead box C2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 501 амінокислот, а молекулярна маса — 53 719[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MQARYSVSDP
|
|
NALGVVPYLS
|
|
EQNYYRAAGS
|
|
YGGMASPMGV
|
|
YSGHPEQYSA
|
| GMGRSYAPYH
|
|
HHQPAAPKDL
|
|
VKPPYSYIAL
|
|
ITMAIQNAPE
|
|
KKITLNGIYQ
|
| FIMDRFPFYR
|
|
ENKQGWQNSI
|
|
RHNLSLNECF
|
|
VKVPRDDKKP
|
|
GKGSYWTLDP
|
| DSYNMFENGS
|
|
FLRRRRRFKK
|
|
KDVSKEKEER
|
|
AHLKEPPPAA
|
|
SKGAPATPHL
|
| ADAPKEAEKK
|
|
VVIKSEAASP
|
|
ALPVITKVET
|
|
LSPESALQGS
|
|
PRSAASTPAG
|
| SPDGSLPEHH
|
|
AAAPNGLPGF
|
|
SVENIMTLRT
|
|
SPPGGELSPG
|
|
AGRAGLVVPP
|
| LALPYAAAPP
|
|
AAYGQPCAQG
|
|
LEAGAAGGYQ
|
|
CSMRAMSLYT
|
|
GAERPAHMCV
|
| PPALDEALSD
|
|
HPSGPTSPLS
|
|
ALNLAAGQEG
|
|
ALAATGHHHQ
|
|
HHGHHHPQAP
|
| PPPPAPQPQP
|
|
TPQPGAAAAQ
|
|
AASWYLNHSG
|
|
DLNHLPGHTF
|
|
AAQQQTFPNV
|
| REMFNSHRLG
|
|
IENSTLGESQ
|
|
VSGNASCQLP
|
|
YRSTPPLYRH
|
|
AAPYSYDCTK
|
| Y
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Miura N., Iida K., Kakinuma H., Yang X.-L., Sugiyama T. (1997). Isolation of the mouse (MFH-1) and human (FKHL 14) mesenchyme fork head-1 genes reveals conservation of their gene and protein structures. Genomics. 41: 489—492. PMID 9169153 doi:10.1006/geno.1997.4695
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- van Dongen M.J., Cederberg A., Carlsson P., Enerback S., Wikstrom M. (2000). Solution structure and dynamics of the DNA-binding domain of the adipocyte-transcription factor FREAC-11. J. Mol. Biol. 296: 351—359. PMID 10669593 doi:10.1006/jmbi.1999.3476
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|