| FOXE3
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| FOXE3, FKHL12, FREAC8, forkhead box E3, AAT11, ASGD2, CTRCT34 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 601094 MGI: 1353569 GeneCards: FOXE3
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| cataract 34 multiple types, early-onset posterior polar cataract[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• transcription regulator complex • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• positive regulation of lens epithelial cell proliferation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of lens fiber cell differentiation • розвиток клітин • positive regulation of epithelial cell proliferation • iris morphogenesis • cornea development in camera-type eye • negative regulation of apoptotic process • ciliary body morphogenesis • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • trabecular meshwork development • camera-type eye development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • розвиток ока • lens development in camera-type eye • mRNA transcription by RNA polymerase II • anatomical structure morphogenesis • диференціація клітин
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 1: 47.42 – 47.42 Mb
| Хр. 4: 114.78 – 114.78 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
FOXE3 (англ. Forkhead box E3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 319 амінокислот, а молекулярна маса — 33 234[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MAGRSDMDPP
|
|
AAFSGFPALP
|
|
AVAPSGPPPS
|
|
PLAGAEPGRE
|
|
PEEAAAGRGE
|
| AAPTPAPGPG
|
|
RRRRRPLQRG
|
|
KPPYSYIALI
|
|
AMALAHAPGR
|
|
RLTLAAIYRF
|
| ITERFAFYRD
|
|
SPRKWQNSIR
|
|
HNLTLNDCFV
|
|
KVPREPGNPG
|
|
KGNYWTLDPA
|
| AADMFDNGSF
|
|
LRRRKRFKRA
|
|
ELPAHAAAAP
|
|
GPPLPFPYAP
|
|
YAPAPGPALL
|
| VPPPSAGPGP
|
|
SPPARLFSVD
|
|
SLVNLQPELA
|
|
GLGAPEPPCC
|
|
AAPDAAAAAF
|
| PPCAAAASPP
|
|
LYSQVPDRLV
|
|
LPATRPGPGP
|
|
LPAEPLLALA
|
|
GPAAALGPLS
|
| PGEAYLRQPG
|
|
FASGLERYL
|
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Semina E.V., Brownell I., Mintz-Hittner H.A., Murray J.C., Jamrich M. (2001). Mutations in the human forkhead transcription factor FOXE3 associated with anterior segment ocular dysgenesis and cataracts. Hum. Mol. Genet. 10: 231—236. PMID 11159941 doi:10.1093/hmg/10.3.231
- Wang Y., Li W., Wang Y., Huang Y. (2012). Growth inhibition of human lens epithelial cells by short hairpin RNA in transcription factor forkhead box E3 (FOXE3). Graefes Arch. Clin. Exp. Ophthalmol. 250: 999—1007. PMID 22527307 doi:10.1007/s00417-012-1944-5
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|