| HOXD10
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| HOXD10, HOX4, HOX4D, HOX4E, Hox-4.4, homeobox D10 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 142984 MGI: 96202 HomoloGene: 1619 GeneCards: HOXD10
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| бічний аміотрофічний склероз, rocker bottom foot[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • chromatin binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • cytoplasmic ribonucleoprotein granule
|
|---|
| Біологічний процес |
• embryonic skeletal system morphogenesis • forelimb morphogenesis • peripheral nervous system neuron development • skeletal system development • proximal/distal pattern formation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • spinal cord motor neuron cell fate specification • adult locomotory behavior • hindlimb morphogenesis • transcription, DNA-templated • single fertilization • multicellular organism development • neuromuscular process • embryonic limb morphogenesis • регуляція експресії генів • skeletal muscle tissue development • anterior/posterior pattern specification • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 2: 176.11 – 176.12 Mb
| Хр. 2: 74.52 – 74.53 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
HOXD10 (англ. Homeobox D10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 340 амінокислот, а молекулярна маса — 38 411[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MSFPNSSPAA
|
|
NTFLVDSLIS
|
|
ACRSDSFYSS
|
|
SASMYMPPPS
|
|
ADMGTYGMQT
|
| CGLLPSLAKR
|
|
EVNHQNMGMN
|
|
VHPYIPQVDS
|
|
WTDPNRSCRI
|
|
EQPVTQQVPT
|
| CSFTTNIKEE
|
|
SNCCMYSDKR
|
|
NKLISAEVPS
|
|
YQRLVPESCP
|
|
VENPEVPVPG
|
| YFRLSQTYAT
|
|
GKTQEYNNSP
|
|
EGSSTVMLQL
|
|
NPRGAAKPQL
|
|
SAAQLQMEKK
|
| MNEPVSGQEP
|
|
TKVSQVESPE
|
|
AKGGLPEERS
|
|
CLAEVSVSSP
|
|
EVQEKESKEE
|
| IKSDTPTSNW
|
|
LTAKSGRKKR
|
|
CPYTKHQTLE
|
|
LEKEFLFNMY
|
|
LTRERRLEIS
|
| KSVNLTDRQV
|
|
KIWFQNRRMK
|
|
LKKMSRENRI
|
|
RELTANLTFS
|
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Redline R.W., Williams A.J., Patterson P., Collins T. (1992). Human HOX4E: a gene strongly expressed in the adult male and female urogenital tracts. Genomics. 13: 425—430. PMID 1351871 doi:10.1016/0888-7543(92)90263-R
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|