| ETV3
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| ETV3, METS, PE-1, PE1, bA110J1.4, ETS variant 3, ETS variant transcription factor 3 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 164873 MGI: 1350926 HomoloGene: 21085 GeneCards: ETV3
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DEAD/H-box RNA helicase binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • молекулярна функція • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• RNA polymerase II transcription repressor complex • transcription repressor complex • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to granulocyte macrophage colony-stimulating factor stimulus • transcription, DNA-templated • negative regulation of cell population proliferation • GO:0022610 життєдіяльність
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 1: 157.12 – 157.14 Mb
| Хр. 3: 87.43 – 87.45 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
ETV3 (англ. ETS variant 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 512 амінокислот, а молекулярна маса — 57 001[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MKAGCSIVEK
|
|
PEGGGGYQFP
|
|
DWAYKTESSP
|
|
GSRQIQLWHF
|
|
ILELLQKEEF
|
| RHVIAWQQGE
|
|
YGEFVIKDPD
|
|
EVARLWGRRK
|
|
CKPQMNYDKL
|
|
SRALRYYYNK
|
| RILHKTKGKR
|
|
FTYKFNFNKL
|
|
VMPNYPFINI
|
|
RSSGVVPQSA
|
|
PPVPTASSRF
|
| HFPPLDTHSP
|
|
TNDVQPGRFS
|
|
ASSLTASGQE
|
|
SSNGTDRKTE
|
|
LSELEDGSAA
|
| DWRRGVDPVS
|
|
SRNAIGGGGI
|
|
GHQKRKPDIM
|
|
LPLFARPGMY
|
|
PDPHSPFAVS
|
| PIPGRGGVLN
|
|
VPISPALSLT
|
|
PTIFSYSPSP
|
|
GLSPFTSSSC
|
|
FSFNPEEMKH
|
| YLHSQACSVF
|
|
NYHLSPRTFP
|
|
RYPGLMVPPL
|
|
QCQMHPEEST
|
|
QFSIKLQPPP
|
| VGRKNRERVE
|
|
SSEESAPVTT
|
|
PTMASIPPRI
|
|
KVEPASEKDP
|
|
ESLRQSAREK
|
| EEHTQEEGTV
|
|
PSRTIEEEKG
|
|
TIFARPAAPP
|
|
IWPSVPISTP
|
|
SGEPLEVTED
|
| SEDRPGKEPS
|
|
APEKKEDALM
|
|
PPKLRLKRRW
|
|
NDDPEARELS
|
|
KSGKFLWNGS
|
| GPQGLATAAA
|
|
DA
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетиляція.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Klemsz M., Hromas R., Raskind W., Bruno E., Hoffman R. (1994). PE-1, a novel ETS oncogene family member, localizes to chromosome 1q21-q23. Genomics. 20: 291—294. PMID 8020980 doi:10.1006/geno.1994.1169
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 doi:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|