| SMAD7
|
|---|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| SMAD7, CRCS3, MADH7, MADH8, SMAD family member 7 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 602932 MGI: 1100518 HomoloGene: 4314 GeneCards: SMAD7
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| колоректальний рак[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • beta-catenin binding • type I transforming growth factor beta receptor binding • collagen binding • I-SMAD binding • activin binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв’язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • центросома • transcription regulator complex • клітинна мембрана • внутрішньоклітинний • нуклеоплазма • catenin complex • клітинне ядро • fibrillar center • гіалоплазма • GO:0009327 protein-containing complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• cellular response to transforming growth factor beta stimulus • regulation of ventricular cardiac muscle cell membrane depolarization • pathway-restricted SMAD protein phosphorylation • ureteric bud development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • adherens junction assembly • positive regulation of cell-cell adhesion • ventricular septum morphogenesis • regulation of epithelial to mesenchymal transition • negative regulation of peptidyl-threonine phosphorylation • negative regulation of transcription by competitive promoter binding • response to laminar fluid shear stress • protein stabilization • regulation of activin receptor signaling pathway • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • BMP signaling pathway • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • negative regulation of pathway-restricted SMAD protein phosphorylation • negative regulation of BMP signaling pathway • ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis • negative regulation of protein ubiquitination • negative regulation of cell migration • negative regulation of ubiquitin-protein transferase activity • artery morphogenesis • negative regulation of peptidyl-serine phosphorylation • regulation of cardiac muscle contraction • positive regulation of protein ubiquitination • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of epithelial to mesenchymal transition • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • transcription, DNA-templated • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • protein deubiquitination • negative regulation of T cell cytokine production • negative regulation of T-helper 17 type immune response • negative regulation of T-helper 17 cell differentiation • cellular response to leukemia inhibitory factor
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 18: 48.92 – 48.95 Mb
| Хр. 18: 75.5 – 75.53 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
SMAD7 (англ. SMAD family member 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 426 амінокислот, а молекулярна маса — 46 426[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MFRTKRSALV
|
|
RRLWRSRAPG
|
|
GEDEEEGAGG
|
|
GGGGGELRGE
|
|
GATDSRAHGA
|
| GGGGPGRAGC
|
|
CLGKAVRGAK
|
|
GHHHPHPPAA
|
|
GAGAAGGAEA
|
|
DLKALTHSVL
|
| KKLKERQLEL
|
|
LLQAVESRGG
|
|
TRTACLLLPG
|
|
RLDCRLGPGA
|
|
PAGAQPAQPP
|
| SSYSLPLLLC
|
|
KVFRWPDLRH
|
|
SSEVKRLCCC
|
|
ESYGKINPEL
|
|
VCCNPHHLSR
|
| LCELESPPPP
|
|
YSRYPMDFLK
|
|
PTADCPDAVP
|
|
SSAETGGTNY
|
|
LAPGGLSDSQ
|
| LLLEPGDRSH
|
|
WCVVAYWEEK
|
|
TRVGRLYCVQ
|
|
EPSLDIFYDL
|
|
PQGNGFCLGQ
|
| LNSDNKSQLV
|
|
QKVRSKIGCG
|
|
IQLTREVDGV
|
|
WVYNRSSYPI
|
|
FIKSATLDNP
|
| DSRTLLVHKV
|
|
FPGFSIKAFD
|
|
YEKAYSLQRP
|
|
NDHEFMQQPW
|
|
TGFTVQISFV
|
| KGWGQCYTRQ
|
|
FISSCPCWLE
|
|
VIFNSR
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|