| ZNF35
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| ZNF35, HF.10, HF10, Zfp105, zinc finger protein 35 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 194533 MGI: 1277119 HomoloGene: 2568 GeneCards: ZNF35
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • зв’язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• cellular response to retinoic acid • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • Сперматогенез • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 3: 44.65 – 44.66 Mb
| Хр. 9: 122.75 – 122.76 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
ZNF35 (англ. Zinc finger protein 35) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 527 амінокислот, а молекулярна маса — 59 089[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MTAELREAMA
|
|
LAPWGPVKVK
|
|
KEEEEEENFP
|
|
GQASSQQVHS
|
|
ENIKVWAPVQ
|
| GLQTGLDGSE
|
|
EEEKGQNISW
|
|
DMAVVLKATQ
|
|
EAPAASTLGS
|
|
YSLPGTLAKS
|
| EILETHGTMN
|
|
FLGAETKNLQ
|
|
LLVPKTEICE
|
|
EAEKPLIISE
|
|
RIQKADPQGP
|
| ELGEACEKGN
|
|
MLKRQRIKRE
|
|
KKDFRQVIVN
|
|
DCHLPESFKE
|
|
EENQKCKKSG
|
| GKYSLNSGAV
|
|
KNPKTQLGQK
|
|
PFTCSVCGKG
|
|
FSQSANLVVH
|
|
QRIHTGEKPF
|
| ECHECGKAFI
|
|
QSANLVVHQR
|
|
IHTGQKPYVC
|
|
SKCGKAFTQS
|
|
SNLTVHQKIH
|
| SLEKTFKCNE
|
|
CEKAFSYSSQ
|
|
LARHQKVHIT
|
|
EKCYECNECG
|
|
KTFTRSSNLI
|
| VHQRIHTGEK
|
|
PFACNDCGKA
|
|
FTQSANLIVH
|
|
QRSHTGEKPY
|
|
ECKECGKAFS
|
| CFSHLIVHQR
|
|
IHTAEKPYDC
|
|
SECGKAFSQL
|
|
SCLIVHQRIH
|
|
SGDLPYVCNE
|
| CGKAFTCSSY
|
|
LLIHQRIHNG
|
|
EKPYTCNECG
|
|
KAFRQRSSLT
|
|
VHQRTHTGEK
|
| PYECEKCGAA
|
|
FISNSHLMRH
|
|
HRTHLVE
|
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|