| MYF5
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| MYF5, bHLHc2, myogenic factor 5, EORVA |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 159990 MGI: 97252 HomoloGene: 4085 GeneCards: MYF5
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • E-box binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• somitogenesis • embryonic skeletal system morphogenesis • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • muscle organ morphogenesis • осифікація • positive regulation of muscle cell differentiation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • muscle cell fate commitment • muscle organ development • extracellular matrix organization • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of skeletal muscle fiber development • transcription, DNA-templated • regulation of cell-matrix adhesion • multicellular organism development • positive regulation of myoblast fusion • positive regulation of myoblast differentiation • muscle tissue morphogenesis • skeletal muscle cell differentiation • camera-type eye development • skeletal muscle tissue development • cartilage condensation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 12: 80.72 – 80.72 Mb
| Хр. 10: 107.32 – 107.32 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
MYF5 (англ. Myogenic factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 255 амінокислот, а молекулярна маса — 28 296[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MDVMDGCQFS
|
|
PSEYFYDGSC
|
|
IPSPEGEFGD
|
|
EFVPRVAAFG
|
|
AHKAELQGSD
|
| EDEHVRAPTG
|
|
HHQAGHCLMW
|
|
ACKACKRKST
|
|
TMDRRKAATM
|
|
RERRRLKKVN
|
| QAFETLKRCT
|
|
TTNPNQRLPK
|
|
VEILRNAIRY
|
|
IESLQELLRE
|
|
QVENYYSLPG
|
| QSCSEPTSPT
|
|
SNCSDGMPEC
|
|
NSPVWSRKSS
|
|
TFDSIYCPDV
|
|
SNVYATDKNS
|
| LSSLDCLSNI
|
|
VDRITSSEQP
|
|
GLPLQDLASL
|
|
SPVASTDSQP
|
|
ATPGASSSRL
|
| IYHVL
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, міогенез.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|