| IRF3
|
|---|
 |
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
| Список кодів PDB |
|
3QU6, 1J2F, 1QWT, 1T2K, 1ZOQ, 2O61, 2O6G, 2PI0, 3A77, 5JEO, 5JEK, 5JER, 5JEM, 5JEL, 5JEJ
| | |
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| IRF3, entrez:3661, IIAE7, interferon regulatory factor 3 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 603734 MGI: 1859179 HomoloGene: 1208 GeneCards: IRF3
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001104 transcription coregulator activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein domain specific binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • identical protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • нуклеоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0097285 апоптоз • positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • macrophage apoptotic process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • response to bacterium • response to exogenous dsRNA • positive regulation of interferon-alpha production • MDA-5 signaling pathway • interferon-gamma-mediated signaling pathway • процес імунної системи • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • cellular response to dsRNA • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • response to lipopolysaccharide • defense response to virus • type I interferon signaling pathway • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • negative regulation of type I interferon production • programmed necrotic cell death • GO:0022415 viral process • cellular response to lipopolysaccharide • positive regulation of type I interferon production • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • positive regulation of interferon-beta production • вроджений імунітет • regulation of type I interferon production • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of defense response to virus by host • регуляція експресії генів • regulation of inflammatory response • cellular response to exogenous dsRNA • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 19: 49.66 – 49.67 Mb
| Хр. 7: 44.65 – 44.65 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
IRF3 (англ. Interferon regulatory factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 427 амінокислот, а молекулярна маса — 47 219[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MGTPKPRILP
|
|
WLVSQLDLGQ
|
|
LEGVAWVNKS
|
|
RTRFRIPWKH
|
|
GLRQDAQQED
|
| FGIFQAWAEA
|
|
TGAYVPGRDK
|
|
PDLPTWKRNF
|
|
RSALNRKEGL
|
|
RLAEDRSKDP
|
| HDPHKIYEFV
|
|
NSGVGDFSQP
|
|
DTSPDTNGGG
|
|
STSDTQEDIL
|
|
DELLGNMVLA
|
| PLPDPGPPSL
|
|
AVAPEPCPQP
|
|
LRSPSLDNPT
|
|
PFPNLGPSEN
|
|
PLKRLLVPGE
|
| EWEFEVTAFY
|
|
RGRQVFQQTI
|
|
SCPEGLRLVG
|
|
SEVGDRTLPG
|
|
WPVTLPDPGM
|
| SLTDRGVMSY
|
|
VRHVLSCLGG
|
|
GLALWRAGQW
|
|
LWAQRLGHCH
|
|
TYWAVSEELL
|
| PNSGHGPDGE
|
|
VPKDKEGGVF
|
|
DLGPFIVDLI
|
|
TFTEGSGRSP
|
|
RYALWFCVGE
|
| SWPQDQPWTK
|
|
RLVMVKVVPT
|
|
CLRALVEMAR
|
|
VGGASSLENT
|
|
VDLHISNSHP
|
| LSLTSDQYKA
|
|
YLQDLVEGMD
|
|
FQGPGES
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, противірусний захист, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Au W.W.-C., Moore P.P.A., Lowther W.W., Juang Y.-T., Pitha P.M. (1995). Identification of a member of the interferon regulatory factor family that binds to the interferon-stimulated response element and activates expression of interferon-induced genes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 11657—11661. PMID 8524823 doi:10.1073/pnas.92.25.11657
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Bellingham J., Gregory-Evans K., Gregory-Evans C.Y. (1998). Mapping of human interferon regulatory factor 3 (IRF3) to chromosome 19q13.3-13.4 by an intragenic polymorphic marker. Ann. Hum. Genet. 62: 231—234. PMID 9803267 doi:10.1046/j.1469-1809.1998.6230231.x
- Lin R., Heylbroeck C., Pitha P.M., Hiscott J. (1998). Virus-dependent phosphorylation of the IRF-3 transcription factor regulates nuclear translocation, transactivation potential, and proteasome-mediated degradation. Mol. Cell. Biol. 18: 2986—2996. PMID 9566918 doi:10.1128/MCB.18.5.2986
- Kumar K.P., McBride K.M., Weaver B.K., Dingwall C., Reich N.C. (2000). Regulated nuclear-cytoplasmic localization of interferon regulatory factor 3, a subunit of double-stranded RNA-activated factor 1. Mol. Cell. Biol. 20: 4159—4168. PMID 10805757 doi:10.1128/MCB.20.11.4159-4168.2000
- Smith E.J., Marie I.J., Prakash A., Garcia-Sastre A., Levy D.E. (2001). IRF3 and IRF7 phosphorylation in virus-infected cells does not require double-stranded RNA-dependent protein kinase R or Ikappa B kinase but is blocked by Vaccinia virus E3L protein. J. Biol. Chem. 276: 8951—8957. PMID 11124948 doi:10.1074/jbc.M008717200
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|