| FOXI1
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| FOXI1, FKH10, FKHL10, FREAC-6, FREAC6, HFH-3, HFH3, forkhead box I1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 601093 MGI: 1096329 HomoloGene: 8140 GeneCards: FOXI1
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding, bending • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • ядерце • внутрішньоклітинна мембранна органела
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • inner ear morphogenesis • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • anatomical structure morphogenesis • диференціація клітин • embryo development ending in birth or egg hatching • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 5: 170.11 – 170.11 Mb
| Хр. 11: 34.15 – 34.16 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
FOXI1 (англ. Forkhead box I1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 378 амінокислот, а молекулярна маса — 40 973[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MSSFDLPAPS
|
|
PPRCSPQFPS
|
|
IGQEPPEMNL
|
|
YYENFFHPQG
|
|
VPSPQRPSFE
|
| GGGEYGATPN
|
|
PYLWFNGPTM
|
|
TPPPYLPGPN
|
|
ASPFLPQAYG
|
|
VQRPLLPSVS
|
| GLGGSDLGWL
|
|
PIPSQEELMK
|
|
LVRPPYSYSA
|
|
LIAMAIHGAP
|
|
DKRLTLSQIY
|
| QYVADNFPFY
|
|
NKSKAGWQNS
|
|
IRHNLSLNDC
|
|
FKKVPRDEDD
|
|
PGKGNYWTLD
|
| PNCEKMFDNG
|
|
NFRRKRKRKS
|
|
DVSSSTASLA
|
|
LEKTESSLPV
|
|
DSPKTTEPQD
|
| ILDGASPGGT
|
|
TSSPEKRPSP
|
|
PPSGAPCLNS
|
|
FLSSMTAYVS
|
|
GGSPTSHPLV
|
| TPGLSPEPSD
|
|
KTGQNSLTFN
|
|
SFSPLTNLSN
|
|
HSGGGDWANP
|
|
MPTNMLSYGG
|
| SVLSQFSPHF
|
|
YNSVNTSGVL
|
|
YPREGTEV
|
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Overdier D.G., Ye H., Peterson R.S., Clevidence D.E., Costa R.H. (1997). The winged helix transcriptional activator HFH-3 is expressed in the distal tubules of embryonic and adult mouse kidney. J. Biol. Chem. 272: 13725—13730. PMID 9153225 doi:10.1074/jbc.272.21.13725
- Pierrou S., Hellqvist M., Samuelsson L., Enerbaeck S., Carlsson P. (1994). Cloning and characterization of seven human forkhead proteins: binding site specificity and DNA bending. EMBO J. 13: 5002—5012. PMID 7957066
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|