| NKX2-3
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| NKX2-3, CSX3, NK2.3, NKX2.3, NKX2C, NKX4-3, NK2 homeobox 3 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 606727 MGI: 97348 HomoloGene: 17061 GeneCards: NKX2-3
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • молекулярна функція • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • компонент клітини
|
|---|
| Біологічний процес |
• leukocyte homeostasis • CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation • post-embryonic digestive tract morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • plasma cell differentiation • spleen development • Післязародковий розвиток • transcription, DNA-templated • macrophage differentiation • mucosa-associated lymphoid tissue development • odontogenesis of dentin-containing tooth • gland morphogenesis • regulation of cell population proliferation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • B cell differentiation • Peyer's patch development • digestive tract development • lymph node development • triglyceride metabolic process • leukocyte migration • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0022610 життєдіяльність • диференціація клітин
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 10: 99.53 – 99.54 Mb
| Хр. 19: 43.6 – 43.6 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
NKX2-3 (англ. NK2 homeobox 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 364 амінокислот, а молекулярна маса — 38 406[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MMLPSPVTST
|
|
PFSVKDILNL
|
|
EQQHQHFHGA
|
|
HLQADLEHHF
|
|
HSAPCMLAAA
|
| EGTQFSDGGE
|
|
EDEEDEGEKL
|
|
SYLNSLAAAD
|
|
GHGDSGLCPQ
|
|
GYVHTVLRDS
|
| CSEPKEHEEE
|
|
PEVVRDRSQK
|
|
SCQLKKSLET
|
|
AGDCKAAEES
|
|
ERPKPRSRRK
|
| PRVLFSQAQV
|
|
FELERRFKQQ
|
|
RYLSAPEREH
|
|
LASSLKLTST
|
|
QVKIWFQNRR
|
| YKCKRQRQDK
|
|
SLELGAHAPP
|
|
PPPRRVAVPV
|
|
LVRDGKPCVT
|
|
PSAQAYGAPY
|
| SVGASAYSYN
|
|
SFPAYGYGNS
|
|
AAAAAAAAAA
|
|
AAAAAAYSSS
|
|
YGCAYPAGGG
|
| GGGGGTSAAT
|
|
TAMQPACSAA
|
|
GGGPFVNVSN
|
|
LGGFGSGGSA
|
|
QPLHQGTAAG
|
| AACAQGTLQG
|
|
IRAW
|
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|