NKX2-1

NKX2-1
Ідентифікатори
Символи NKX2-1, Nkx2-1, AV026640, Nkx2.1, T/EBP, Titf1, Ttf-1, BCH, BHC, NK-2, NKX2A, TEBP, TTF1, NMTC1, NK2 homeobox 1
Зовнішні ІД OMIM: 600635 MGI: 108067 HomoloGene: 2488 GeneCards: NKX2-1
Пов'язані генетичні захворювання
хорея, brain-lung-thyroid syndrome[1]
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7080
21869
Ensembl
ENSG00000136352
ENSMUSG00000001496
UniProt
P43699
P50220
RefSeq (мРНК)
NM_001079668
NM_003317
NM_001146198
NM_009385
RefSeq (білок)
NP_001073136
NP_003308
NP_033411
NP_001390509
Локус (UCSC) Хр. 14: 36.52 – 36.52 Mb Хр. 12: 56.58 – 56.58 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NKX2-1 (англ. NK2 homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 371 амінокислот, а молекулярна маса — 38 596[5].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MSMSPKHTTP FSVSDILSPL EESYKKVGME GGGLGAPLAA YRQGQAAPPT
AAMQQHAVGH HGAVTAAYHM TAAGVPQLSH SAVGGYCNGN LGNMSELPPY
QDTMRNSASG PGWYGANPDP RFPAISRFMG PASGMNMSGM GGLGSLGDVS
KNMAPLPSAP RRKRRVLFSQ AQVYELERRF KQQKYLSAPE REHLASMIHL
TPTQVKIWFQ NHRYKMKRQA KDKAAQQQLQ QDSGGGGGGG GTGCPQQQQA
QQQSPRRVAV PVLVKDGKPC QAGAPAPGAA SLQGHAQQQA QHQAQAAQAA
AAAISVGSGG AGLGAHPGHQ PGSAGQSPDL AHHAASPAAL QGQVSSLSHL
NSSGSDYGTM SCSTLLYGRT W

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Oguchi H., Pan Y.-T., Kimura S. (1995). The complete nucleotide sequence of the mouse thyroid-specific enhancer-binding protein (T/EBP) gene: extensive identity of the deduced amino acid sequence with the human protein. Biochim. Biophys. Acta. 1261: 304—306. PMID 7711079 doi:10.1016/0167-4781(95)00033-D
  • Saiardi A., Tassi V., de Filippis V., Civitareale D. (1995). Cloning and sequence analysis of human thyroid transcription factor 1. Biochim. Biophys. Acta. 1261: 307—310. PMID 7711080 doi:10.1016/0167-4781(95)00034-E
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
  • Doyle D.A., Gonzalez I., Thomas B., Scavina M. (2004). Autosomal dominant transmission of congenital hypothyroidism, neonatal respiratory distress, and ataxia caused by a mutation of NKX2-1. J. Pediatr. 145: 190—193. PMID 15289765 doi:10.1016/j.jpeds.2004.04.011
  • Williamson S., Kirkpatrick M., Greene S., Goudie D. (2014). A novel mutation of NKX2-1 affecting 2 generations with hypothyroidism and choreoathetosis: part of the spectrum of brain-thyroid-lung syndrome. J. Child Neurol. 29: 666—669. PMID 24453141 doi:10.1177/0883073813518243

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з NKX2-1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11825 (англ.) . Архів оригіналу за 26 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-26 у Wayback Machine.]
  5. UniProt, P43699 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також