HOXC10

HOXC10
Ідентифікатори
Символи	HOXC10, HOX3I, homeobox C10
Зовнішні ІД	OMIM: 605560 MGI: 96192 HomoloGene: 9680 GeneCards: HOXC10
Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• cyclin-dependent protein kinase activating kinase holoenzyme complex; • клітинне ядро; • ядерні тільця; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• multicellular organism development; • skeletal system development; • proximal/distal pattern formation; • neuromuscular process; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • embryonic limb morphogenesis; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of cell population proliferation; • anterior/posterior pattern specification; • spinal cord motor neuron cell fate specification; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of cold-induced thermogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3226
	209448
	ENSG00000180818
	ENSMUSG00000022484
	Q9NYD6
	P31257
	NM_017409
	NM_010462
	NP_059105
	NP_034592
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HOXC10 (англ. Homeobox C10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 342 амінокислот, а молекулярна маса — 38 073^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTCPRNVTPN	SYAEPLAAPG	GGERYSRSAG	MYMQSGSDFN	CGVMRGCGLA
PSLSKRDEGS	SPSLALNTYP	SYLSQLDSWG	DPKAAYRLEQ	PVGRPLSSCS
YPPSVKEENV	CCMYSAEKRA	KSGPEAALYS	HPLPESCLGE	HEVPVPSYYR
ASPSYSALDK	TPHCSGANDF	EAPFEQRASL	NPRAEHLESP	QLGGKVSFPE
TPKSDSQTPS	PNEIKTEQSL	AGPKGSPSES	EKERAKAADS	SPDTSDNEAK
EEIKAENTTG	NWLTAKSGRK	KRCPYTKHQT	LELEKEFLFN	MYLTRERRLE
ISKTINLTDR	QVKIWFQNRR	MKLKKMNREN	RIRELTSNFN	FT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Flagiello D., Gibaud A., Dutrillaux B., Poupon M.-F., Malfoy B. (1997). Distinct patterns of all-trans retinoic acid dependent expression of HOXB and HOXC homeogenes in human embryonal and small-cell lung carcinoma cell lines. FEBS Lett. 415: 263—267. PMID 9357979 doi:10.1016/S0014-5793(97)01118-6
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 doi:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5122 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9NYD6 (англ.) . Архів оригіналу за 7 червня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5122 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9NYD6 (англ.) . Архів оригіналу за 7 червня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]