NPAS1

NPAS1
Ідентифікатори
Символи	NPAS1, MOP5, PASD5, bHLHe11, neuronal PAS domain protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603346 MGI: 109205 HomoloGene: 1886 GeneCards: NPAS1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • DNA binding; • protein dimerization activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • protein heterodimerization activity;
Клітинна компонента	• клітинне ядро;
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • central nervous system development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • переляк; • Maternal behavior; • transcription, DNA-templated; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	4861
	18142
	ENSG00000130751
	ENSMUSG00000001988
	Q99742
	P97459
	NM_002517; NM_001321086
	NM_008718
	NP_001308015; NP_002508
	NP_032744
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NPAS1 (англ. Neuronal PAS domain protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 590 амінокислот, а молекулярна маса — 62 702^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAPYPGSGG	GSEVKCVGGR	GASVPWDFLP	GLMVKAPSGP	CLQAQRKEKS
RNAARSRRGK	ENLEFFELAK	LLPLPGAISS	QLDKASIVRL	SVTYLRLRRF
AALGAPPWGL	RAAGPPAGLA	PGRRGPAALV	SEVFEQHLGG	HILQSLDGFV
FALNQEGKFL	YISETVSIYL	GLSQVEMTGS	SVFDYIHPGD	HSEVLEQLGL
RTPTPGPPTP	PSVSSSSSSS	SSLADTPEIE	ASLTKVPPSS	LVQERSFFVR
MKSTLTKRGL	HVKASGYKVI	HVTGRLRAHA	LGLVALGHTL	PPAPLAELPL
HGHMIVFRLS	LGLTILACES	RVSDHMDLGP	SELVGRSCYQ	FVHGQDATRI
RQSHVDLLDK	GQVMTGYYRW	LQRAGGFVWL	QSVATVAGSG	KSPGEHHVLW
VSHVLSQAEG	GQTPLDAFQL	PASVACEEAS	SPGPEPTEPE	PPTEGKQAAP
AENEAPQTQG	KRIKVEPGPR	ETKGSEDSGD	EDPSSHPATP	RPEFTSVIRA
GVLKQDPVRP	WGLAPPGDPP	PTLLHAGFLP	PVVRGLCTPG	TIRYGPAELG
LVYPHLQRLG	PGPALPEAFY	PPLGLPYPGP	AGTRLPRKGD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7894 (англ.) . Архів оригіналу за 3 червня 2016. Процитовано 21 вересня 2017. [Архівовано 2016-06-03 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q99742 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2016. Процитовано 21 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7894 (англ.) . Архів оригіналу за 3 червня 2016. Процитовано 21 вересня 2017. [Архівовано 2016-06-03 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q99742 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2016. Процитовано 21 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]