SOX21

SOX21
Ідентифікатори
Символи	SOX21, SOX25, SRY-box 21, SRY-box transcription factor 21
Зовнішні ІД	OMIM: 604974 MGI: 2654070 HomoloGene: 5143 GeneCards: SOX21
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • DNA binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • компонент клітини;
Біологічний процес	• hair follicle development; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • hair cycle; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • stem cell differentiation; • skin development; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • диференціація клітин; • central nervous system development; • neuron differentiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	11166
	223227
	ENSG00000125285
	ENSMUSG00000061517
	Q9Y651
	Q811W0
	NM_007084
	NM_177753
	NP_009015
	NP_808421
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SOX21 (англ. SRY-box 21) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 276 амінокислот, а молекулярна маса — 28 580^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSKPVDHVKR	PMNAFMVWSR	AQRRKMAQEN	PKMHNSEISK	RLGAEWKLLT
ESEKRPFIDE	AKRLRAMHMK	EHPDYKYRPR	RKPKTLLKKD	KFAFPVPYGL
GGVADAEHPA	LKAGAGLHAG	AGGGLVPESL	LANPEKAAAA	AAAAAARVFF
PQSAAAAAAA	AAAAAAGSPY	SLLDLGSKMA	EISSSSSGLP	YASSLGYPTA
GAGAFHGAAA	AAAAAAAAAG	GHTHSHPSPG	NPGYMIPCNC	SAWPSPGLQP
PLAYILLPGM	GKPQLDPYPA	AYAAAL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Malas S., Duthie S., Deloukas P., Episkopou V. (1999). The isolation and high-resolution chromosomal mapping of human SOX14 and SOX21; two members of the SOX gene family related to SOX1, SOX2, and SOX3. Mamm. Genome. 10: 934—937. PMID 10441749 doi:10.1007/s003359901118

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11197 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9Y651 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 13

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11197 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9Y651 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]