| CEBPD
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| CEBPD, C/EBP-delta, CELF, CRP3, NF-IL6-beta, CCAAT/enhancer binding protein delta, CCAAT enhancer binding protein delta |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 116898 MGI: 103573 HomoloGene: 3808 GeneCards: CEBPD
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • protein homodimerization activity • protein heterodimerization activity
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • нуклеоплазма
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • cytokine-mediated signaling pathway • hematopoietic progenitor cell differentiation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • fat cell differentiation • positive regulation of osteoblast differentiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • inner ear development
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 8: 47.74 – 47.74 Mb
| Хр. 16: 15.71 – 15.71 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
CEBPD (англ. CCAAT/enhancer binding protein delta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 269 амінокислот, а молекулярна маса — 28 467[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MSAALFSLDG
|
|
PARGAPWPAE
|
|
PAPFYEPGRA
|
|
GKPGRGAEPG
|
|
ALGEPGAAAP
|
| AMYDDESAID
|
|
FSAYIDSMAA
|
|
VPTLELCHDE
|
|
LFADLFNSNH
|
|
KAGGAGPLEL
|
| LPGGPARPLG
|
|
PGPAAPRLLK
|
|
REPDWGDGDA
|
|
PGSLLPAQVA
|
|
ACAQTVVSLA
|
| AAGQPTPPTS
|
|
PEPPRSSPRQ
|
|
TPAPGPAREK
|
|
SAGKRGPDRG
|
|
SPEYRQRRER
|
| NNIAVRKSRD
|
|
KAKRRNQEMQ
|
|
QKLVELSAEN
|
|
EKLHQRVEQL
|
|
TRDLAGLRQF
|
| FKQLPSPPFL
|
|
PAAGTADCR
|
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Kinoshita S., Akira S., Kishimoto T. (1992). A member of the C/EBP family, NF-IL6 beta, forms a heterodimer and transcriptionally synergizes with NF-IL6. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 1473—1476. PMID 1741402 doi:10.1073/pnas.89.4.1473
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Wang J.-M., Ko C.-Y., Chen L.-C., Wang W.-L., Chang W.-C. (2006). Functional role of NF-IL6beta and its sumoylation and acetylation modifications in promoter activation of cyclooxygenase 2 gene. Nucleic Acids Res. 34: 217—231. PMID 16397300 doi:10.1093/nar/gkj422
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|