TFAP2C

TFAP2C
Ідентифікатори
Символи	TFAP2C, AP2-GAMMA, ERF1, TFAP2G, hAP-2g, transcription factor AP-2 gamma
Зовнішні ІД	OMIM: 601602 MGI: 106032 HomoloGene: 2423 GeneCards: TFAP2C
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein dimerization activity; • DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• мітохондрія; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • cell-cell signaling; • male gonad development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of cell population proliferation; • Епігенетичне успадкування; • transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	7022
	21420
	ENSG00000087510
	ENSMUSG00000028640
	Q92754
	Q61312
	NM_003222
	NM_001159696; NM_009335
	NP_003213
	NP_001153168; NP_033361
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TFAP2C (англ. Transcription factor AP-2 gamma) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 450 амінокислот, а молекулярна маса — 49 177^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLWKITDNVK	YEEDCEDRHD	GSSNGNPRVP	HLSSAGQHLY	SPAPPLSHTG
VAEYQPPPYF	PPPYQQLAYS	QSADPYSHLG	EAYAAAINPL	HQPAPTGSQQ
QAWPGRQSQE	GAGLPSHHGR	PAGLLPHLSG	LEAGAVSARR	DAYRRSDLLL
PHAHALDAAG	LAENLGLHDM	PHQMDEVQNV	DDQHLLLHDQ	TVIRKGPISM
TKNPLNLPCQ	KELVGAVMNP	TEVFCSVPGR	LSLLSSTSKY	KVTVAEVQRR
LSPPECLNAS	LLGGVLRRAK	SKNGGRSLRE	KLDKIGLNLP	AGRRKAAHVT
LLTSLVEGEA	VHLARDFAYV	CEAEFPSKPV	AEYLTRPHLG	GRNEMAARKN
MLLAAQQLCK	EFTELLSQDR	TPHGTSRLAP	VLETNIQNCL	SHFSLITHGF
GSQAICAAVS	ALQNYIKEAL	IVIDKSYMNP	GDQSPADSNK	TLEKMEKHRK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

McPherson L.A., Baichwal V.R., Weigel R.J. (1997). Identification of ERF-1 as a member of the AP2 transcription factor family. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 4342—4347. PMID 9113991 doi:10.1073/pnas.94.9.4342
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Eloranta J.J., Hurst H.C. (2002). Transcription factor AP-2 interacts with the SUMO-conjugating enzyme UBC9 and is sumolated in vivo. J. Biol. Chem. 277: 30798—30804. PMID 12072434 doi:10.1074/jbc.M202780200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11744 (англ.) . Архів оригіналу за 1 липня 2016. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2016-07-01 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q92754 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11744 (англ.) . Архів оригіналу за 1 липня 2016. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2016-07-01 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q92754 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]