HIVEP1

HIVEP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1BBO, 4ZNF
Ідентифікатори
Символи	HIVEP1, CIRIP, CRYBP1, GAAP, MBP-1, PRDII-BF1, Schnurri-1, ZAS1, ZNF40, ZNF40A, human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, HIVEP zinc finger 1
Зовнішні ІД	OMIM: 194540 MGI: 96100 HomoloGene: 1596 GeneCards: HIVEP1
Пов'язані генетичні захворювання
	токсикоманія
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв’язування з іоном металу; • nucleic acid binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мітохондрія; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • ядерні тільця;
Біологічний процес	• multicellular organism development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • transcription, DNA-templated; • BMP signaling pathway; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3096
	110521
	ENSG00000095951
	ENSMUSG00000021366
	P15822
	Q03172
	NM_002114
	NM_007772
	NP_002105
	NP_031798
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HIVEP1 (англ. Human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 718 амінокислот, а молекулярна маса — 296 865^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPRTKQIHPR	NLRDKIEEAQ	KELNGAEVSK	KEILQAGVKG	TSESLKGVKR
KKIVAENHLK	KIPKSPLRNP	LQAKHKQNTE	ESSFAVLHSA	SESHKKQNYI
PVKNGKQFTK	QNGETPGIIA	EASKSEESVS	PKKPLFLQQP	SELRRWRSEG
ADPAKFSDLD	EQCDSSSLSS	KTRTDNSECI	SSHCGTTSPS	YTNTAFDVLL
KAMEPELSTL	SQKGSPCAIK	TEKLRPNKTA	RSPPKLKNSS	MDAPNQTSQE
LVAESQSSCT	SYTVHMSAAQ	KNEQGAMQSA	SHLYHQHEHF	VPKSNQHNQQ
LPGCSGFTGS	LTNLQNQENA	KLEQVYNIAV	TSSVGLTSPS	SRSQVTPQNQ
QMDSASPLSI	SPANSTQSPP	MPIYNSTHVA	SVVNQSVEQM	CNLLLKDQKP
KKQGKYICEY	CNRACAKPSV	LLKHIRSHTG	ERPYPCVTCG	FSFKTKSNLY
KHKKSHAHTI	KLGLVLQPDA	GGLFLSHESP	KALSIHSDVE	DSGESEEEGA
TDERQHDLGA	MELQPVHIIK	RMSNAETLLK	SSFTPSSPEN	VIGDFLLQDR
SAESQAVTEL	PKVVVHHVTV	SPLRTDSPKA	MDPKPELSSA	QKQKDLQVTN
VQPLSANMSQ	GGVSRLETNE	NSHQKGDMNP	LEGKQDSHVG	TVHAQLQRQQ
ATDYSQEQQG	KLLSPRSLGS	TDSGYFSRSE	SADQTVSPPT	PFARRLPSTE
QDSGRSNGPS	AALVTTSTPS	ALPTGEKALL	LPGQMRPPLA	TKTLEERISK
LISDNEALVD	DKQLDSVKPR	RTSLSRRGSI	DSPKSYIFKD	SFQFDLKPVG
RRTSSSSDIP	KSPFTPTEKS	KQVFLLSVPS	LDCLPITRSN	SMPTTGYSAV
PANIIPPPHP	LRGSQSFDDK	IGTFYDDVFV	SGPNAPVPQS	GHPRTLVRQA
AIEDSSANES	HVLGTGQSLD	ESHQGCHAAG	EAMSVRSKAL	AQGPHIEKKK
SHQGRGTMFE	CETCRNRYRK	LENFENHKKF	YCSELHGPKT	KVAMREPEHS
PVPGGLQPQI	LHYRVAGSSG	IWEQTPQIRK	RRKMKSVGDD	EELQQNESGT
SPKSSEGLQF	QNALGCNPSL	PKHNVTIRSD	QQHKNIQLQN	SHIHLVARGP
EQTMDPKLST	IMEQQISSAA	QDKIELQRHG	TGISVIQHTN	SLSRPNSFDK
PEPFERASPV	SFQELNRTGK	SGSLKVIGIS	QEESHPSRDG	SHPHQLALSD
ALRGELQESS	RKSPSERHVL	GQPSRLVRQH	NIQVPEILVT	EEPDRDLEAQ
CHDQEKSEKF	SWPQRSETLS	KLPTEKLPPK	KKRLRLAEIE	HSSTESSFDS
TLSRSLSRES	SLSHTSSFSA	SLDIEDVSKT	EASPKIDFLN	KAEFLMIPAG
LNTLNVPGCH	REMRRTASEQ	INCTQTSMEV	SDLRSKSFDC	GSITPPQTTP
LTELQPPSSP	SRVGVTGHVP	LLERRRGPLV	RQISLNIAPD	SHLSPVHPTS
FQNTALPSVN	AVPYQGPQLT	STSLAEFSAN	TLHSQTQVKD	LQAETSNSSS
TNVFPVQQLC	DINLLNQIHA	PPSHQSTQLS	LQVSTQGSKP	DKNSVLSGSS
KSEDCFAPKY	QLHCQVFTSG	PSCSSNPVHS	LPNQVISDPV	GTDHCVTSAT
LPTKLIDSMS	NSHPLLPPEL	RPLGSQVQKV	PSSFMLPIRL	QSSVPAYCFA
TLTSLPQILV	TQDLPNQPIC	QTNHSVVPIS	EEQNSVPTLQ	KGHQNALPNP
EKEFLCENVF	SEMSQNSSLS	ESLPITQKIS	VGRLSPQQES	SASSKRMLSP
ANSLDIAMEK	HQKRAKDENG	AVCATDVRPL	EALSSRVNEA	SKQKKPILVR
QVCTTEPLDG	VMLEKDVFSQ	PEISNEAVNL	TNVLPADNSS	TGCSKFVVIE
PISELQEFEN	IKSSTSLTLT	VRSSPAPSEN	THISPLKCTD	NNQERKSPGV
KNQGDKVNIQ	EQSQQPVTSL	SLFNIKDTQQ	LAFPSLKTTT	NFTWCYLLRQ
KSLHLPQKDQ	KTSAYTDWTV	SASNPNPLGL	PTKVALALLN	SKQNTGKSLY
CQAITTHSKS	DLLVYSSKWK	SSLSKRALGN	QKSTVVEFSN	KDASEINSEQ
DKENSLIKSE	PRRIKIFDGG	YKSNEEYVYV	RGRGRGKYIC	EECGIRCKKP
SMLKKHIRTH	TDVRPYHCTY	CNFSFKTKGN	LTKHMKSKAH	SKKCVDLGVS
VGLIDEQDTE	ESDEKQRFSY	ERSGYDLEES	DGPDEDDNEN	EDDDEDSQAE
SVLSATPSVT	ASPQHLPSRS	SLQDPVSTDE	DVRITDCFSG	VHTDPMDVLP
RALLTRMTVL	STAQSDYNRK	TLSPGKARQR	AARDENDTIP	SVDTSRSPCH
QMSVDYPESE	EILRSSMAGK	AVAITQSPSS	VRLPPAAAEH	SPQTAAGMPS
VASPHPDPQE	QKQQITLQPT	PGLPSPHTHL	FSHLPLHSQQ	QSRTPYNMVP
VGGIHVVPAG	LTYSTFVPLQ	AGPVQLTIPA	VSVVHRTLGT	HRNTVTEVSG
TTNPAGVAEL	SSVVPCIPIG	QIRVPGLQNL	STPGLQSLPS	LSMETVNIVG
LANTNMAPQV	HPPGLALNAV	GLQVLTANPS	SQSSPAPQAH	IPGLQILNIA
LPTLIPSVSQ	VAVDAQGAPE	MPASQSKACE	TQPKQTSVAS	ANQVSRTESP
QGLPTVQREN	AKKVLNPPAP	AGDHARLDGL	SKMDTEKAAS	ANHVKPKPEL
TSIQGQPAST	SQPLLKAHSE	VFTKPSGQQT	LSPDRQVPRP	TALPRRQPTV
HFSDVSSDDD	EDRLVIAT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Fan C.M., Maniatis T. (1990). A DNA-binding protein containing two widely separated zinc finger motifs that recognize the same DNA sequence. Genes Dev. 4: 29—42. PMID 2106471 doi:10.1101/gad.4.1.29
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Baldwin A.S. Jr., LeClair K.P., Singh H., Sharp P.A. (1990). A large protein containing zinc finger domains binds to related sequence elements in the enhancers of the class I major histocompatibility complex and kappa immunoglobulin genes. Mol. Cell. Biol. 10: 1406—1414. PMID 2108316 doi:10.1128/MCB.10.4.1406
Lallemand C., Palmieri M., Blanchard B., Meritet J.F., Tovey M.G. (2002). GAAP-1: a transcriptional activator of p53 and IRF-1 possesses pro-apoptotic activity. EMBO Rep. 3: 153—158. PMID 11818340 doi:10.1093/embo-reports/kvf032
Yu B., Mitchell G.A., Richter A. (2009). Cirhin up-regulates a canonical NF-kappaB element through strong interaction with Cirip/HIVEP1. Exp. Cell Res. 315: 3086—3098. PMID 19732766 doi:10.1016/j.yexcr.2009.08.017
Omichinski J.G., Clore G.M., Appella E., Sakaguchi K., Gronenborn A.M. (1990). High-resolution three-dimensional structure of a single zinc finger from a human enhancer binding protein in solution. Biochemistry. 29: 9324—9334. PMID 2248949 doi:10.1021/bi00492a004

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з HIVEP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4920 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P15822 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

[1] Захворювання, генетично пов'язані з HIVEP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4920 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P15822 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]