POU2F2

POU2F2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1HDP
Ідентифікатори
Символи	POU2F2, OCT2, OTF2, Oct-2, POU class 2 homeobox 2
Зовнішні ІД	OMIM: 164176 MGI: 101897 HomoloGene: 55674 GeneCards: POU2F2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • protein domain specific binding; • DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • sequence-specific DNA binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • цитоплазма; • нуклеоплазма; • внутрішньоклітинна мембранна органела;
Біологічний процес	• humoral immune response; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • cell maturation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • transcription, DNA-templated; • mature B cell differentiation; • transcription by RNA polymerase II; • snRNA transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5452
	18987
	ENSG00000028277
	ENSMUSG00000008496
	P09086
	Q00196
NM_001207025; NM_001207026; NM_001247994; NM_002698; NM_001393934;
	NM_001393935; NM_001393936; NM_001394376; NM_001394377; NM_001394378
	NM_001163554; NM_001163555; NM_001163556; NM_011138
	NP_001193954; NP_001193955; NP_001234923; NP_002689
	NP_001157026; NP_001157027; NP_001157028; NP_035268
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

POU2F2 (англ. POU class 2 homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 479 амінокислот, а молекулярна маса — 51 209^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVHSSMGAPE	IRMSKPLEAE	KQGLDSPSEH	TDTERNGPDT	NHQNPQNKTS
PFSVSPTGPS	TKIKAEDPSG	DSAPAAPLPP	QPAQPHLPQA	QLMLTGSQLA
GDIQQLLQLQ	QLVLVPGHHL	QPPAQFLLPQ	AQQSQPGLLP	TPNLFQLPQQ
TQGALLTSQP	RAGLPTQAVT	RPTLPDPHLS	HPQPPKCLEP	PSHPEEPSDL
EELEQFARTF	KQRRIKLGFT	QGDVGLAMGK	LYGNDFSQTT	ISRFEALNLS
FKNMCKLKPL	LEKWLNDAET	MSVDSSLPSP	NQLSSPSLGF	DGLPGRRRKK
RTSIETNVRF	ALEKSFLANQ	KPTSEEILLI	AEQLHMEKEV	IRVWFCNRRQ
KEKRINPCSA	APMLPSPGKP	ASYSPHMVTP	QGGAGTLPLS	QASSSLSTTV
TTLSSAVGTL	HPSRTAGGGG	GGGGAAPPLN	SIPSVTPPPP	ATTNSTNPSP
QGSHSAIGLS	GLNPSTGPGL	WWNPAPYQP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Clerc R.G., Corcoran L.M., Lebowitz J.H., Baltimore D., Sharp P.A. (1988). The B-cell-specific Oct-2 protein contains POU box- and homeo box-type domains. Genes Dev. 2: 1570—1581. PMID 3265124 doi:10.1101/gad.2.12a.1570
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Mueller M.M., Ruppert S., Schaffner W., Matthias P. (1988). A cloned octamer transcription factor stimulates transcription from lymphoid-specific promoters in non-B cells. Nature. 336: 544—551. PMID 2904653 doi:10.1038/336544a0
Ko H.-S., Fast P., McBride W., Staudt L.M. (1988). A human protein specific for the immunoglobulin octamer DNA motif contains a functional homeobox domain. Cell. 55: 135—144. PMID 2901913 doi:10.1016/0092-8674(88)90016-5
Tanaka M., Lai J.-S., Herr W. (1992). Promoter-selective activation domains in Oct-1 and Oct-2 direct differential activation of an snRNA and mRNA promoter. Cell. 68: 755—767. PMID 1739980 doi:10.1016/0092-8674(92)90150-B
Sivaraja M., Botfield M.C., Mueller M., Jancso A., Weiss M.A. (1994). Solution structure of a POU-specific homeodomain: 3D-NMR studies of human B-cell transcription factor Oct-2. Biochemistry. 33: 9845—9855. PMID 7914745 doi:10.1021/bi00199a005

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9213 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P09086 (англ.) . Архів оригіналу за 10 березня 2018. Процитовано 21 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9213 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P09086 (англ.) . Архів оригіналу за 10 березня 2018. Процитовано 21 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]