| IRF7
|
|---|
|
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| IRF7, IRF-7H, IRF7A, IRF7B, IRF7C, IRF7H, IMD39, interferon regulatory factor 7, IRF-7 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 605047 MGI: 1859212 HomoloGene: 128624 GeneCards: IRF7
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • endosome membrane • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма
|
|---|
| Біологічний процес |
• positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of interferon-alpha production • MDA-5 signaling pathway • interferon-gamma-mediated signaling pathway • процес імунної системи • regulation of adaptive immune response • response to virus • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of type I interferon production • cellular response to DNA damage stimulus • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • negative regulation of macrophage apoptotic process • type I interferon signaling pathway • immunoglobulin mediated immune response • establishment of viral latency • regulation of immune response • GO:0022415 viral process • regulation of monocyte differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of interferon-beta production • interferon-beta production • regulation of MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • positive regulation of type I interferon production • вроджений імунітет • regulation of MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • interferon-alpha production • defense response to virus • регуляція експресії генів
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 11: 0.61 – 0.62 Mb
| Хр. 7: 140.84 – 140.85 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
IRF7 (англ. Interferon regulatory factor 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 503 амінокислот, а молекулярна маса — 54 278[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MALAPERAAP
|
|
RVLFGEWLLG
|
|
EISSGCYEGL
|
|
QWLDEARTCF
|
|
RVPWKHFARK
|
| DLSEADARIF
|
|
KAWAVARGRW
|
|
PPSSRGGGPP
|
|
PEAETAERAG
|
|
WKTNFRCALR
|
| STRRFVMLRD
|
|
NSGDPADPHK
|
|
VYALSRELCW
|
|
REGPGTDQTE
|
|
AEAPAAVPPP
|
| QGGPPGPFLA
|
|
HTHAGLQAPG
|
|
PLPAPAGDKG
|
|
DLLLQAVQQS
|
|
CLADHLLTAS
|
| WGADPVPTKA
|
|
PGEGQEGLPL
|
|
TGACAGGPGL
|
|
PAGELYGWAV
|
|
ETTPSPGPQP
|
| AALTTGEAAA
|
|
PESPHQAEPY
|
|
LSPSPSACTA
|
|
VQEPSPGALD
|
|
VTIMYKGRTV
|
| LQKVVGHPSC
|
|
TFLYGPPDPA
|
|
VRATDPQQVA
|
|
FPSPAELPDQ
|
|
KQLRYTEELL
|
| RHVAPGLHLE
|
|
LRGPQLWARR
|
|
MGKCKVYWEV
|
|
GGPPGSASPS
|
|
TPACLLPRNC
|
| DTPIFDFRVF
|
|
FQELVEFRAR
|
|
QRRGSPRYTI
|
|
YLGFGQDLSA
|
|
GRPKEKSLVL
|
| VKLEPWLCRV
|
|
HLEGTQREGV
|
|
SSLDSSSLSL
|
|
CLSSANSLYD
|
|
DIECFLMELE
|
| QPA
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, противірусний захист, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Zhang L., Pagano J.S. (1997). IRF-7, a new interferon regulatory factor associated with Epstein-Barr virus latency. Mol. Cell. Biol. 17: 5748—5757. PMID 9315633 doi:10.1128/MCB.17.10.5748
- Au W.-C., Moore P.A., LaFleur D.W., Tombal B., Pitha P.M. (1998). Characterization of the interferon regulatory factor-7 and its potential role in the transcription activation of interferon A genes. J. Biol. Chem. 273: 29210—29217. PMID 9786932 doi:10.1074/jbc.273.44.29210
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Marie I.J., Smith E., Prakash A., Levy D.E. (2000). Phosphorylation-induced dimerization of interferon regulatory factor 7 unmasks DNA binding and a bipartite transactivation domain. Mol. Cell. Biol. 20: 8803—8814. PMID 11073981 doi:10.1128/MCB.20.23.8803-8814.2000
- Smith E.J., Marie I.J., Prakash A., Garcia-Sastre A., Levy D.E. (2001). IRF3 and IRF7 phosphorylation in virus-infected cells does not require double-stranded RNA-dependent protein kinase R or Ikappa B kinase but is blocked by Vaccinia virus E3L protein. J. Biol. Chem. 276: 8951—8957. PMID 11124948 doi:10.1074/jbc.M008717200
- Zhang L., Pagano J.S. (2002). Structure and function of IRF-7. J. Interferon Cytokine Res. 22: 95—101. PMID 11846980 doi:10.1089/107999002753452700
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|