| POU4F3
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| POU4F3, BRN3C, DFNA15, POU class 4 homeobox 3, DFNA42, DFNA52 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 602460 MGI: 102523 HomoloGene: 2023 GeneCards: POU4F3
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| autosomal dominant nonsyndromic deafness 15, nonsyndromic deafness[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • слух • inner ear development • зріння (видіннє) • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • диференціація клітин • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • vestibulocochlear nerve development • retinal ganglion cell axon guidance • inner ear morphogenesis • inner ear auditory receptor cell differentiation • axon extension • neuromuscular process controlling balance • neuron apoptotic process • inner ear receptor cell differentiation
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 5: 146.34 – 146.34 Mb
| Хр. 18: 42.53 – 42.53 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
POU4F3 (англ. POU class 4 homeobox 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 338 амінокислот, а молекулярна маса — 37 052[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MMAMNSKQPF
|
|
GMHPVLQEPK
|
|
FSSLHSGSEA
|
|
MRRVCLPAPQ
|
|
LQGNIFGSFD
|
| ESLLARAEAL
|
|
AAVDIVSHGK
|
|
NHPFKPDATY
|
|
HTMSSVPCTS
|
|
TSSTVPISHP
|
| AALTSHPHHA
|
|
VHQGLEGDLL
|
|
EHISPTLSVS
|
|
GLGAPEHSVM
|
|
PAQIHPHHLG
|
| AMGHLHQAMG
|
|
MSHPHTVAPH
|
|
SAMPACLSDV
|
|
ESDPRELEAF
|
|
AERFKQRRIK
|
| LGVTQADVGA
|
|
ALANLKIPGV
|
|
GSLSQSTICR
|
|
FESLTLSHNN
|
|
MIALKPVLQA
|
| WLEEAEAAYR
|
|
EKNSKPELFN
|
|
GSERKRKRTS
|
|
IAAPEKRSLE
|
|
AYFAIQPRPS
|
| SEKIAAIAEK
|
|
LDLKKNVVRV
|
|
WFCNQRQKQK
|
|
RMKYSAVH
|
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|