| HOXD3
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| HOXD3, HOX1D, HOX4, HOX4A, Hox-4.1, homeobox D3 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 142980 MGI: 96207 HomoloGene: 5034 GeneCards: HOXD3
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• aggresome • нуклеоплазма • клітинне ядро • ядерні тільця
|
|---|
| Біологічний процес |
• Сигнальний шлях Notch • glossopharyngeal nerve morphogenesis • embryonic skeletal system morphogenesis • multicellular organism development • thyroid gland development • cartilage development • GO:1901313 positive regulation of gene expression • cell-matrix adhesion • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of neuron differentiation • transcription, DNA-templated • anterior/posterior pattern specification • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|


 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 2: 176.14 – 176.17 Mb
| Хр. 2: 74.54 – 74.58 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
HOXD3 (англ. Homeobox D3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 432 амінокислот, а молекулярна маса — 45 730[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MLFEQGQQAL
|
|
ELPECTMQKA
|
|
AYYENPGLFG
|
|
GYGYSKTTDT
|
|
YGYSTPHQPY
|
| PPPAAASSLD
|
|
TDYPGSACSI
|
|
QSSAPLRAPA
|
|
HKGAELNGSC
|
|
MRPGTGNSQG
|
| GGGGSQPPGL
|
|
NSEQQPPQPP
|
|
PPPPTLPPSS
|
|
PTNPGGGVPA
|
|
KKPKGGPNAS
|
| SSSATISKQI
|
|
FPWMKESRQN
|
|
SKQKNSCATA
|
|
GESCEDKSPP
|
|
GPASKRVRTA
|
| YTSAQLVELE
|
|
KEFHFNRYLC
|
|
RPRRVEMANL
|
|
LNLTERQIKI
|
|
WFQNRRMKYK
|
| KDQKAKGILH
|
|
SPASQSPERS
|
|
PPLGGAAGHV
|
|
AYSGQLPPVP
|
|
GLAYDAPSPP
|
| AFAKSQPNMY
|
|
GLAAYTAPLS
|
|
SCLPQQKRYA
|
|
APEFEPHPMA
|
|
SNGGGFASAN
|
| LQGSPVYVGG
|
|
NFVESMAPAS
|
|
GPVFNLGHLS
|
|
HPSSASVDYS
|
|
CAAQIPGNHH
|
| HGPCDPHPTY
|
|
TDLSAHHSSQ
|
|
GRLPEAPKLT
|
|
HL
|
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|