KDM3B

KDM3B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4C8D
Ідентифікатори
Символи	KDM3B, 5qNCA, C5orf7, JMJD1B, NET22, lysine demethylase 3B, DIJOS
Зовнішні ІД	OMIM: 609373 MGI: 1923356 HomoloGene: 41145 GeneCards: KDM3B
Онтологія гена
Молекулярна функція	• oxidoreductase activity; • antioxidant activity; • dioxygenase activity; • зв’язування з іоном металу; • histone demethylase activity; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • chromatin DNA binding; • histone H3-methyl-lysine-9 demethylase activity;
Клітинна компонента	• хроматин; • клітинне ядро; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• cellular oxidant detoxification; • response to cisplatin; • transcription, DNA-templated; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • histone H3-K9 demethylation; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	51780
	277250
	ENSG00000120733
	ENSMUSG00000038773
	Q7LBC6
	Q6ZPY7
	NM_016604
	NM_001081256; NM_029518
	NP_057688
	NP_001074725
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

KDM3B (англ. Lysine demethylase 3B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 761 амінокислот, а молекулярна маса — 191 581^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADAAASPVG	KRLLLLFADT	AASASASAPA	AAAASGDPGP	ALRTRAWRAG
TVRAMSGAVP	QDLAIFVEFD	GCNWKQHSWV	KVHAEEVIVL	LLEGSLVWAP
REDPVLLQGI	RVSIAQWPAL	TFTPLVDKLG	LGSVVPVEYL	LDRELRFLSD
ANGLHLFQMG	TDSQNQILLE	HAALRETVNA	LISDQKLQEI	FSRGPYSVQG
HRVKIYQPEG	EEGWLYGVVS	HQDSITRLME	VSVTESGEIK	SVDPRLIHVM
LMDNSAPQSE	GGTLKAVKSS	KGKKKRESIE	GKDGRRRKSA	SDSGCDPASK
KLKGDRGEVD	SNGSDGGEAS	RGPWKGGNAS	GEPGLDQRAK	QPPSTFVPQI
NRNIRFATYT	KENGRTLVVQ	DEPVGGDTPA	SFTPYSTATG	QTPLAPEVGG
AENKEAGKTL	EQVGQGIVAS	AAVVTTASST	PNTVRISDTG	LAAGTVPEKQ
KGSRSQASGE	NSRNSILASS	GFGAPLPSSS	QPLTFGSGRS	QSNGVLATEN
KPLGFSFGCS	SAQEAQKDTD	LSKNLFFQCM	SQTLPTSNYF	TTVSESLADD
SSSRDSFKQS	LESLSSGLCK	GRSVLGTDTK	PGSKAGSSVD	RKVPAESMPT
LTPAFPRSLL	NARTPENHEN	LFLQPPKLSR	EEPSNPFLAF	VEKVEHSPFS
SFASQASGSS	SSATTVTSKV	APSWPESHSS	ADSASLAKKK	PLFITTDSSK
LVSGVLGSAL	TSGGPSLSAM	GNGRSSSPTS	SLTQPIEMPT	LSSSPTEERP
TVGPGQQDNP	LLKTFSNVFG	RHSGGFLSSP	ADFSQENKAP	FEAVKRFSLD
ERSLACRQDS	DSSTNSDLSD	LSDSEEQLQA	KTGLKGIPEH	LMGKLGPNGE
RSAELLLGKS	KGKQAPKGRP	RTAPLKVGQS	VLKDVSKVKK	LKQSGEPFLQ
DGSCINVAPH	LHKCRECRLE	RYRKFKEQEQ	DDSTVACRFF	HFRRLIFTRK
GVLRVEGFLS	PQQSDPDAMN	LWIPSSSLAE	GIDLETSKYI	LANVGDQFCQ
LVMSEKEAMM	MVEPHQKVAW	KRAVRGVREM	CDVCETTLFN	IHWVCRKCGF
GVCLDCYRLR	KSRPRSETEE	MGDEEVFSWL	KCAKGQSHEP	ENLMPTQIIP
GTALYNIGDM	VHAARGKWGI	KANCPCISRQ	NKSVLRPAVT	NGMSQLPSIN
PSASSGNETT	FSGGGGPAPV	TTPEPDHVPK	ADSTDIRSEE	PLKTDSSASN
SNSELKAIRP	PCPDTAPPSS	ALHWLADLAT	QKAKEETKEA	GSLRSVLNKE
SHSPFGLDSF	NSTAKVSPLT	PKLFNSLLLG	PTASNNKTEG	SSLRDLLHSG
PGKLPQTPLD	TGIPFPPVFS	TSSAGVKSKA	SLPNFLDHII	ASVVENKKTS
DASKRACNLT	DTQKEVKEMV	MGLNVLDPHT	SHSWLCDGRL	LCLHDPSNKN
NWKIFRECWK	QGQPVLVSGV	HKKLKSELWK	PEAFSQEFGD	QDVDLVNCRN
CAIISDVKVR	DFWDGFEIIC	KRLRSEDGQP	MVLKLKDWPP	GEDFRDMMPT
RFEDLMENLP	LPEYTKRDGR	LNLASRLPSY	FVRPDLGPKM	YNAYGLITAE
DRRVGTTNLH	LDVSDAVNVM	VYVGIPIGEG	AHDEEVLKTI	DEGDADEVTK
QRIHDGKEKP	GALWHIYAAK	DAEKIRELLR	KVGEEQGQEN	PPDHDPIHDQ
SWYLDQTLRK	RLYEEYGVQG	WAIVQFLGDA	VFIPAGAPHQ	VHNLYSCIKV
AEDFVSPEHV	KHCFRLTQEF	RHLSNTHTNH	EDKLQVKNII	YHAVKDAVGT
LKAHESKLAR	S

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1337 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q7LBC6 (англ.) . Архів оригіналу за 11 жовтня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1337 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q7LBC6 (англ.) . Архів оригіналу за 11 жовтня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]