IRX3

IRX3
Ідентифікатори
Символи	IRX3, IRX-1, IRXB1, iroquois homeobox 3
Зовнішні ІД	OMIM: 612985 MGI: 1197522 HomoloGene: 7385 GeneCards: IRX3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • аксон; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• multicellular organism development; • mesoderm development; • specification of loop of Henle identity; • metanephros development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of neuron differentiation; • positive regulation of neuron differentiation; • transcription, DNA-templated; • proximal/distal pattern formation involved in nephron development; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • energy homeostasis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	79191
	16373
	ENSG00000177508
	ENSMUSG00000031734
	P78415
	P81067
	NM_024336
	NM_001253822; NM_008393
	NP_077312
	NP_001240751; NP_032419
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

IRX3 (англ. Iroquois homeobox 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 501 амінокислот, а молекулярна маса — 52 119^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSFPQLGYQY	IRPLYPSERP	GAAGGSGGSA	GARGGLGAGA	SELNASGSLS
NVLSSVYGAP	YAAAAAAAAA	QGYGAFLPYA	AELPIFPQLG	AQYELKDSPG
VQHPAAAAAF	PHPHPAFYPY	GQYQFGDPSR	PKNATRESTS	TLKAWLNEHR
KNPYPTKGEK	IMLAIITKMT	LTQVSTWFAN	ARRRLKKENK	MTWAPRSRTD
EEGNAYGSER	EEEDEEEDEE	DGKRELELEE	EELGGEEEDT	GGEGLADDDE
DEEIDLENLD	GAATEPELSL	AGAARRDGDL	GLGPISDSKN	SDSEDSSEGL
EDRPLPVLSL	APAPPPVAVA	SPSLPSPPVS	LDPCAPAPAP	ASALQKPKIW
SLAETATSPD	NPRRSPPGAG	GSPPGAAVAP	SALQLSPAAA	AAAAHRLVSA
PLGKFPAWTN	RPFPGPPPGP	RLHPLSLLGS	APPHLLGLPG	AAGHPAAAAA
FARPAEPEGG	TDRCSALEVE	KKLLKTAFQP	VPRRPQNHLD	AALVLSALSS
S

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14360 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P78415 (англ.) . Архів оригіналу за 25 листопада 2016. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14360 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P78415 (англ.) . Архів оригіналу за 25 листопада 2016. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]