| TOX4
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| TOX4, C14orf92, KIAA0737, LCP1, MIG7, TOX high mobility group box family member 4 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 614032 MGI: 1915389 HomoloGene: 8889 GeneCards: TOX4
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• хроматин • клітинне ядро • PTW/PP1 phosphatase complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|


 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 14: 21.48 – 21.5 Mb
| Хр. 14: 52.52 – 52.53 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
TOX4 (англ. TOX high mobility group box family member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 621 амінокислот, а молекулярна маса — 66 195[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MEFPGGNDNY
|
|
LTITGPSHPF
|
|
LSGAETFHTP
|
|
SLGDEEFEIP
|
|
PISLDSDPSL
|
| AVSDVVGHFD
|
|
DLADPSSSQD
|
|
GSFSAQYGVQ
|
|
TLDMPVGMTH
|
|
GLMEQGGGLL
|
| SGGLTMDLDH
|
|
SIGTQYSANP
|
|
PVTIDVPMTD
|
|
MTSGLMGHSQ
|
|
LTTIDQSELS
|
| SQLGLSLGGG
|
|
TILPPAQSPE
|
|
DRLSTTPSPT
|
|
SSLHEDGVED
|
|
FRRQLPSQKT
|
| VVVEAGKKQK
|
|
APKKRKKKDP
|
|
NEPQKPVSAY
|
|
ALFFRDTQAA
|
|
IKGQNPNATF
|
| GEVSKIVASM
|
|
WDSLGEEQKQ
|
|
VYKRKTEAAK
|
|
KEYLKALAAY
|
|
KDNQECQATV
|
| ETVELDPAPP
|
|
SQTPSPPPMA
|
|
TVDPASPAPA
|
|
SIEPPALSPS
|
|
IVVNSTLSSY
|
| VANQASSGAG
|
|
GQPNITKLII
|
|
TKQMLPSSIT
|
|
MSQGGMVTVI
|
|
PATVVTSRGL
|
| QLGQTSTATI
|
|
QPSQQAQIVT
|
|
RSVLQAAAAA
|
|
AAAASMQLPP
|
|
PRLQPPPLQQ
|
| MPQPPTQQQV
|
|
TILQQPPPLQ
|
|
AMQQPPPQKV
|
|
RINLQQQPPP
|
|
LQIKSVPLPT
|
| LKMQTTLVPP
|
|
TVESSPERPM
|
|
NNSPEAHTVE
|
|
APSPETICEM
|
|
ITDVVPEVES
|
| PSQMDVELVS
|
|
GSPVALSPQP
|
|
RCVRSGCENP
|
|
PIVSKDWDNE
|
|
YCSNECVVKH
|
| CRDVFLAWVA
|
|
SRNSNTVVFV
|
|
K
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|