| TBX2
|
|---|
 |
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| TBX2, T-box 2, VETD, T-box transcription factor 2 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 600747 MGI: 98494 HomoloGene: 38123 GeneCards: TBX2
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• transcription regulator complex • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• Сигнальний шлях Notch • roof of mouth development • atrioventricular canal development • pharynx development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of heart contraction • cardiac muscle tissue development • negative regulation of heart looping • mammary placode formation • embryonic digit morphogenesis • heart morphogenesis • outflow tract morphogenesis • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • aorta morphogenesis • transcription, DNA-templated • embryonic heart tube development • outflow tract septum morphogenesis • endocardial cushion morphogenesis • multicellular organism development • heart looping • muscle cell fate determination • клітинне старіння • developmental growth involved in morphogenesis • positive regulation of cardiac muscle cell proliferation • embryonic camera-type eye morphogenesis • positive regulation of cell population proliferation • negative regulation of cardiac chamber formation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|


 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 17: 61.4 – 61.41 Mb
| Хр. 11: 85.72 – 85.73 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
TBX2 (англ. T-box 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 712 амінокислот, а молекулярна маса — 75 066[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MREPALAASA
|
|
MAYHPFHAPR
|
|
PADFPMSAFL
|
|
AAAQPSFFPA
|
|
LALPPGALAK
|
| PLPDPGLAGA
|
|
AAAAAAAAAA
|
|
AEAGLHVSAL
|
|
GPHPPAAHLR
|
|
SLKSLEPEDE
|
| VEDDPKVTLE
|
|
AKELWDQFHK
|
|
LGTEMVITKS
|
|
GRRMFPPFKV
|
|
RVSGLDKKAK
|
| YILLMDIVAA
|
|
DDCRYKFHNS
|
|
RWMVAGKADP
|
|
EMPKRMYIHP
|
|
DSPATGEQWM
|
| AKPVAFHKLK
|
|
LTNNISDKHG
|
|
FTILNSMHKY
|
|
QPRFHIVRAN
|
|
DILKLPYSTF
|
| RTYVFPETDF
|
|
IAVTAYQNDK
|
|
ITQLKIDNNP
|
|
FAKGFRDTGN
|
|
GRREKRKQLT
|
| LPSLRLYEEH
|
|
CKPERDGAES
|
|
DASSCDPPPA
|
|
REPPTSPGAA
|
|
PSPLRLHRAR
|
| AEEKSCAADS
|
|
DPEPERLSEE
|
|
RAGAPLGRSP
|
|
APDSASPTRL
|
|
TEPERARERR
|
| SPERGKEPAE
|
|
SGGDGPFGLR
|
|
SLEKERAEAR
|
|
RKDEGRKEAA
|
|
EGKEQGLAPL
|
| VVQTDSASPL
|
|
GAGHLPGLAF
|
|
SSHLHGQQFF
|
|
GPLGAGQPLF
|
|
LHPGQFTMGP
|
| GAFSAMGMGH
|
|
LLASVAGGGN
|
|
GGGGGPGTAA
|
|
GLDAGGLGPA
|
|
ASAASTAAPF
|
| PFHLSQHMLA
|
|
SQGIPMPTFG
|
|
GLFPYPYTYM
|
|
AAAAAAASAL
|
|
PATSAAAAAA
|
| AAAGSLSRSP
|
|
FLGSARPRLR
|
|
FSPYQIPVTI
|
|
PPSTSLLTTG
|
|
LASEGSKAAG
|
| GNSREPSPLP
|
|
ELALRKVGAP
|
|
SRGALSPSGS
|
|
AKEAANELQS
|
|
IQRLVSGLES
|
| QRALSPGRES
|
|
PK
|
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Campbell C., Goodrich K., Casey G., Beatty B. (1995). Cloning and mapping of a human gene (TBX2) sharing a highly conserved protein motif with the Drosophila omb gene. Genomics. 28: 255—260. PMID 8530034 doi:10.1006/geno.1995.1139
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Law D.J., Gebuhr T., Garvey N., Agulnik S.I., Silver L.M. (1995). Identification, characterization, and localization to chromosome 17q21-22 of the human TBX2 homolog, member of a conserved developmental gene family. Mamm. Genome. 6: 793—797. PMID 8597636 doi:10.1007/BF00539006
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|