HMGB4

HMGB4
Ідентифікатори
Символи	HMGB4, dJ1007G16.5, high mobility group box 4
Зовнішні ІД	OMIM: 617285 MGI: 1916567 HomoloGene: 83321 GeneCards: HMGB4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • DNA binding; • transcription factor binding; • DNA binding, bending;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • хромосома; • цитоплазма;
Біологічний процес	• activation of innate immune response; • DNA recombination; • ремоделювання хроматину; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of signaling receptor activity; • positive regulation of autophagy; • GO:0007571 розвойовий процес; • positive regulation of interleukin-6 production; • positive regulation of tumor necrosis factor production; • positive regulation of innate immune response; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • cell chemotaxis; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	127540
	69317
	ENSG00000176256
	ENSMUSG00000048686
	Q8WW32
	Q6P8W9
	NM_145205; NM_001352984; NM_001379301
	NM_027036
	NP_660206; NP_001339913; NP_001366230
	NP_081312
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HMGB4 (англ. High mobility group box 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 186 амінокислот, а молекулярна маса — 22 490^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGKEIQLKPK	ANVSSYVHFL	LNYRNKFKEQ	QPNTYVGFKE	FSRKCSEKWR
SISKHEKAKY	EALAKLDKAR	YQEEMMNYVG	KRKKRRKRDP	QEPRRPPSSF
LLFCQDHYAQ	LKRENPNWSV	VQVAKATGKM	WSTATDLEKH	PYEQRVALLR
AKYFEELELY	RKQCNARKKY	RMSARNRCRG	KRVRQS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24954 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8WW32 (англ.) . Архів оригіналу за 23 грудня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24954 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q8WW32 (англ.) . Архів оригіналу за 23 грудня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]