| MYCN
|
|---|
 |
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| MYCN, MODED, N-myc, NMYC, ODED, bHLHe37, v-myc avian myelocytomatosis viral oncogene neuroblastoma derived homolog, MYCN proto-oncogene, bHLH transcription factor, MYCNsORF, MYCNsPEP |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 164840 MGI: 97357 HomoloGene: 3922 GeneCards: MYCN
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • kinase binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• хроматин • клітинне ядро • ядерце
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of gene expression • positive regulation of production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA • transcription by RNA polymerase II • cartilage condensation • positive regulation of mesenchymal cell proliferation • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of cell death • lung development • embryonic digit morphogenesis • regulation of inner ear auditory receptor cell differentiation • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • embryonic skeletal system morphogenesis • negative regulation of astrocyte differentiation • branching morphogenesis of an epithelial tube • negative regulation of reactive oxygen species metabolic process
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|


 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 2: 15.94 – 15.95 Mb
| Хр. 12: 12.99 – 12.99 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
MYCN (англ. MYCN proto-oncogene, bHLH transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 464 амінокислот, а молекулярна маса — 49 561[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MPSCSTSTMP
|
|
GMICKNPDLE
|
|
FDSLQPCFYP
|
|
DEDDFYFGGP
|
|
DSTPPGEDIW
|
| KKFELLPTPP
|
|
LSPSRGFAEH
|
|
SSEPPSWVTE
|
|
MLLENELWGS
|
|
PAEEDAFGLG
|
| GLGGLTPNPV
|
|
ILQDCMWSGF
|
|
SAREKLERAV
|
|
SEKLQHGRGP
|
|
PTAGSTAQSP
|
| GAGAASPAGR
|
|
GHGGAAGAGR
|
|
AGAALPAELA
|
|
HPAAECVDPA
|
|
VVFPFPVNKR
|
| EPAPVPAAPA
|
|
SAPAAGPAVA
|
|
SGAGIAAPAG
|
|
APGVAPPRPG
|
|
GRQTSGGDHK
|
| ALSTSGEDTL
|
|
SDSDDEDDEE
|
|
EDEEEEIDVV
|
|
TVEKRRSSSN
|
|
TKAVTTFTIT
|
| VRPKNAALGP
|
|
GRAQSSELIL
|
|
KRCLPIHQQH
|
|
NYAAPSPYVE
|
|
SEDAPPQKKI
|
| KSEASPRPLK
|
|
SVIPPKAKSL
|
|
SPRNSDSEDS
|
|
ERRRNHNILE
|
|
RQRRNDLRSS
|
| FLTLRDHVPE
|
|
LVKNEKAAKV
|
|
VILKKATEYV
|
|
HSLQAEEHQL
|
|
LLEKEKLQAR
|
| QQQLLKKIEH
|
|
ARTC
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Stanton L.W., Schwab M., Bishop J.M. (1986). Nucleotide sequence of the human N-myc gene. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 1772—1776. PMID 2869488 doi:10.1073/pnas.83.6.1772
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Stanton L.W., Bishop J.M. (1987). Alternative processing of RNA transcribed from NMYC. Mol. Cell. Biol. 7: 4266—4272. PMID 3437890 doi:10.1128/MCB.7.12.4266
- Michitsch R.W., Melera P.W. (1985). Nucleotide sequence of the 3' exon of the human N-myc gene. Nucleic Acids Res. 13: 2545—2558. PMID 2987858 doi:10.1093/nar/13.7.2545
- Secombe J., Li L., Carlos L., Eisenman R.N. (2007). The Trithorax group protein Lid is a trimethyl histone H3K4 demethylase required for dMyc-induced cell growth. Genes Dev. 21: 537—551. PMID 17311883 doi:10.1101/gad.1523007
- Ibson J.M., Rabbitts P.H. (1988). Sequence of a germ-line N-myc gene and amplification as a mechanism of activation. Oncogene. 2: 399—402. PMID 2834684
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|