| DBX2
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| DBX2, developing brain homeobox 2 |
|---|
| Зовнішні ІД |
MGI: 107445 HomoloGene: 54981 GeneCards: DBX2
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 12: 45.01 – 45.05 Mb
| Хр. 15: 95.52 – 95.55 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
DBX2 (англ. Developing brain homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 339 амінокислот, а молекулярна маса — 36 555[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MLPSAVAAHA
|
|
GAYWDVVASS
|
|
ALLNLPAAPG
|
|
FGNLGKSFLI
|
|
ENLLRVGGAP
|
| TPRLQPPAPH
|
|
DPATALATAG
|
|
AQLRPLPASP
|
|
VPLKLCPAAE
|
|
QVSPAGAPYG
|
| TRWAFQVLSP
|
|
SADSARLPGR
|
|
APGDRDCTFQ
|
|
PSAPAPSKPF
|
|
LLSTPPFYSA
|
| CCGGSCRRPA
|
|
SSTAFPREES
|
|
MLPLLTQDSN
|
|
SKARRGILRR
|
|
AVFSEDQRKA
|
| LEKMFQKQKY
|
|
ISKTDRKKLA
|
|
INLGLKESQV
|
|
KIWFQNRRMK
|
|
WRNSKEKEVL
|
| SNRCIQEVGL
|
|
QEDPLSRSAL
|
|
GFPSPCPSIW
|
|
DVPQQHSSPR
|
|
WRENSPEPSE
|
| RLIQESSGAP
|
|
PPEANSLQGA
|
|
LYLCSEEEAG
|
|
SKGVLTGAV
|
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|