| HOXB3
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| HOXB3, HOX2, HOX2G, Hox-2.7, homeobox B3 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 142966 MGI: 96184 HomoloGene: 1617 GeneCards: HOXB3
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• embryonic skeletal system morphogenesis • multicellular organism development • glossopharyngeal nerve morphogenesis • definitive hemopoiesis • thyroid gland development • cartilage development • face development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of neurogenesis • rhombomere development • Ангіогенез • hematopoietic progenitor cell differentiation • transcription, DNA-templated • anterior/posterior pattern specification • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 17: 48.55 – 48.6 Mb
| Хр. 11: 96.21 – 96.24 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
HOXB3 (англ. Homeobox B3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 431 амінокислот, а молекулярна маса — 44 340[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MQKATYYDNA
|
|
AAALFGGYSS
|
|
YPGSNGFGFD
|
|
VPPQPPFQAA
|
|
THLEGDYQRS
|
| ACSLQSLGNA
|
|
APHAKSKELN
|
|
GSCMRPGLAP
|
|
EPLSAPPGSP
|
|
PPSAAPTSAT
|
| SNSSNGGGPS
|
|
KSGPPKCGPG
|
|
TNSTLTKQIF
|
|
PWMKESRQTS
|
|
KLKNNSPGTA
|
| EGCGGGGGGG
|
|
GGGGSGGSGG
|
|
GGGGGGGGDK
|
|
SPPGSAASKR
|
|
ARTAYTSAQL
|
| VELEKEFHFN
|
|
RYLCRPRRVE
|
|
MANLLNLSER
|
|
QIKIWFQNRR
|
|
MKYKKDQKAK
|
| GLASSSGGPS
|
|
PAGSPPQPMQ
|
|
STAGFMNALH
|
|
SMTPSYESPS
|
|
PPAFGKAHQN
|
| AYALPSNYQP
|
|
PLKGCGAPQK
|
|
YPPTPAPEYE
|
|
PHVLQANGGA
|
|
YGTPTMQGSP
|
| VYVGGGGYAD
|
|
PLPPPAGPSL
|
|
YGLNHLSHHP
|
|
SGNLDYNGAP
|
|
PMAPSQHHGP
|
| CEPHPTYTDL
|
|
SSHHAPPPQG
|
|
RIQEAPKLTH
|
|
L
|
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|