JADE1

JADE1
Ідентифікатори
Символи	JADE1, PHF17, jade family PHD finger 1
Зовнішні ІД	OMIM: 610514 MGI: 1925835 HomoloGene: 18162 GeneCards: JADE1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001105 transcription coactivator activity; • зв’язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • клітинна мембрана; • нуклеоплазма; • histone acetyltransferase complex; • клітинне ядро; • ciliary basal body; • цитоскелет; • cell projection; • nuclear speck;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • histone H4-K5 acetylation; • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle; • negative regulation of cell growth; • histone H3 acetylation; • histone H4-K16 acetylation; • histone H4-K8 acetylation; • histone H4-K12 acetylation; • GO:0097285 апоптоз; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway; • transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of nucleic acid-templated transcription;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	79960
	269424
	ENSG00000077684
	ENSMUSG00000025764
	Q6IE81
	Q6ZPI0
NM_001287437; NM_001287439; NM_001287440; NM_001287441; NM_001287442;
	NM_001287443; NM_024900; NM_199320
	NM_001130184; NM_001130185; NM_001130186; NM_172303
NP_001274366; NP_001274368; NP_001274369; NP_001274370; NP_001274371;
	NP_001274372; NP_079176; NP_955352
	NP_001123656; NP_001123657; NP_001123658; NP_758507
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

JADE1 (англ. Jade family PHD finger 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 842 амінокислот, а молекулярна маса — 95 533^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKRGRLPSSS	EDSDDNGSLS	TTWSQNSRSQ	HRRSSCSRHE	DRKPSEVFRT
DLITAMKLHD	SYQLNPDEYY	VLADPWRQEW	EKGVQVPVSP	GTIPQPVARV
VSEEKSLMFI	RPKKYIVSSG	SEPPELGYVD	IRTLADSVCR	YDLNDMDAAW
LELTNEEFKE	MGMPELDEYT	MERVLEEFEQ	RCYDNMNHAI	ETEEGLGIEY
DEDVVCDVCQ	SPDGEDGNEM	VFCDKCNICV	HQACYGILKV	PEGSWLCRTC
ALGVQPKCLL	CPKKGGAMKP	TRSGTKWVHV	SCALWIPEVS	IGSPEKMEPI
TKVSHIPSSR	WALVCSLCNE	KFGASIQCSV	KNCRTAFHVT	CAFDRGLEMK
TILAENDEVK	FKSYCPKHSS	HRKPEESLGK	GAAQENGAPE	CSPRNPLEPF
ASLEQNREEA	HRVSVRKQKL	QQLEDEFYTF	VNLLDVARAL	RLPEEVVDFL
YQYWKLKRKV	NFNKPLITPK	KDEEDNLAKR	EQDVLFRRLQ	LFTHLRQDLE
RVRNLTYMVT	RREKIKRSVC	KVQEQIFNLY	TKLLEQERVS	GVPSSCSSSS
LENMLLFNSP	SVGPDAPKIE	DLKWHSAFFR	KQMGTSLVHS	LKKPHKRDPL
QNSPGSEGKT	LLKQPDLCGR	REGMVVPESF	LGLEKTFAEA	RLISAQQKNG
VVMPDHGKRR	DNRFHCDLIK	GDLKDKSFKQ	SHKPLRSTDV	SQRHLDNTRA
ATSPGVGQSA	PGTRKEIVPK	CNGSLIKVNY	NQTAVKVPTT	PASPVKNWGG
FRIPKKGERQ	QQGEAHDGAC	HQHSDYPYLG	LGRVPAKERA	KSKLKSDNEN
DGYVPDVEMS	DSESEASEKK	CIHTSSTISR	RTDIIRRSIL	AS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних відростках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 doi:10.1093/dnares/8.2.85
Tzouanacou E., Tweedie S., Wilson V. (2003). Identification of Jade1, a gene encoding a PHD zinc finger protein, in a gene trap mutagenesis screen for genes involved in anteroposterior axis development. Mol. Cell. Biol. 23: 8553—8562. PMID 14612400 doi:10.1128/MCB.23.23.8553-8562.2003
Panchenko M.V., Zhou M.I., Cohen H.T. (2004). von Hippel-Lindau partner Jade-1 is a transcriptional co-activator associated with histone acetyltransferase activity. J. Biol. Chem. 279: 56032—56041. PMID 15502158 doi:10.1074/jbc.M410487200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30027 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 30 серпня 2017. [Архівовано 2017-05-28 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q6IE81 (англ.) . Архів оригіналу за 20 червня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30027 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 30 серпня 2017. [Архівовано 2017-05-28 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q6IE81 (англ.) . Архів оригіналу за 20 червня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]