NFATC1

NFATC1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1A66, 1NFA
Ідентифікатори
Символи	NFATC1, NF-ATC, NFAT2, NFATc, NF-ATc1.2, nuclear factor of activated T-cells 1, nuclear factor of activated T cells 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600489 MGI: 102469 HomoloGene: 32336 GeneCards: NFATC1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • mitogen-activated protein kinase p38 binding; • FK506 binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • chromatin binding; • transcription factor binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • ядерні тільця; • transcription regulator complex;
Біологічний процес	• GO:0007243 intracellular signal transduction; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • calcineurin-NFAT signaling cascade; • transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • Fc-epsilon receptor signaling pathway; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • Wnt signaling pathway, calcium modulating pathway; • negative regulation of Wnt signaling pathway; • negative regulation of vascular associated smooth muscle cell differentiation; • GO:0032617 творба цитокінів; • aortic valve morphogenesis; • pulmonary valve morphogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4772
	18018
	ENSG00000131196
	ENSMUSG00000033016
	O95644
	O88942
NM_172390; NM_001278669; NM_001278670; NM_001278672; NM_001278673;
	NM_001278675; NM_006162; NM_172387; NM_172388; NM_172389
NM_001164109; NM_001164110; NM_001164111; NM_001164112; NM_016791;
	NM_198429
NP_001265598; NP_001265599; NP_001265601; NP_001265602; NP_001265604;
	NP_006153; NP_765975; NP_765976; NP_765977; NP_765978
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NFATC1 (англ. Nuclear factor of activated T-cells 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 943 амінокислот, а молекулярна маса — 101 243^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPSTSFPVPS	KFPLGPAAAV	FGRGETLGPA	PRAGGTMKSA	EEEHYGYASS
NVSPALPLPT	AHSTLPAPCH	NLQTSTPGII	PPADHPSGYG	AALDGGPAGY
FLSSGHTRPD	GAPALESPRI	EITSCLGLYH	NNNQFFHDVE	VEDVLPSSKR
SPSTATLSLP	SLEAYRDPSC	LSPASSLSSR	SCNSEASSYE	SNYSYPYASP
QTSPWQSPCV	SPKTTDPEEG	FPRGLGACTL	LGSPRHSPST	SPRASVTEES
WLGARSSRPA	SPCNKRKYSL	NGRQPPYSPH	HSPTPSPHGS	PRVSVTDDSW
LGNTTQYTSS	AIVAAINALT	TDSSLDLGDG	VPVKSRKTTL	EQPPSVALKV
EPVGEDLGSP	PPPADFAPED	YSSFQHIRKG	GFCDQYLAVP	QHPYQWAKPK
PLSPTSYMSP	TLPALDWQLP	SHSGPYELRI	EVQPKSHHRA	HYETEGSRGA
VKASAGGHPI	VQLHGYLENE	PLMLQLFIGT	ADDRLLRPHA	FYQVHRITGK
TVSTTSHEAI	LSNTKVLEIP	LLPENSMRAV	IDCAGILKLR	NSDIELRKGE
TDIGRKNTRV	RLVFRVHVPQ	PSGRTLSLQV	ASNPIECSQR	SAQELPLVEK
QSTDSYPVVG	GKKMVLSGHN	FLQDSKVIFV	EKAPDGHHVW	EMEAKTDRDL
CKPNSLVVEI	PPFRNQRITS	PVHVSFYVCN	GKRKRSQYQR	FTYLPANVPI
IKTEPTDDYE	PAPTCGPVSQ	GLSPLPRPYY	SQQLAMPPDP	SSCLVAGFPP
CPQRSTLMPA	APGVSPKLHD	LSPAAYTKGV	ASPGHCHLGL	PQPAGEAPAV
QDVPRPVATH	PGSPGQPPPA	LLPQQVSAPP	SSSCPPGLEH	SLCPSSPSPP
LPPATQEPTC	LQPCSPACPP	ATGRPQHLPS	TVRRDESPTA	GPRLLPEVHE
DGSPNLAPIP	VTVKREPEEL	DQLYLDDVNE	IIRNDLSSTS	THS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Park J., Takeuchi A., Sharma S. (1996). Characterization of a new isoform of the NFAT (nuclear factor of activated T cells) gene family member NFATc. J. Biol. Chem. 271: 20914—20921. PMID 8702849 doi:10.1074/jbc.271.34.20914
Vihma H., Pruunsild P., Timmusk T. (2008). Alternative splicing and expression of human and mouse NFAT genes. Genomics. 92: 279—291. PMID 18675896 doi:10.1016/j.ygeno.2008.06.011
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Lyakh L., Ghosh P., Rice N.R. (1997). Expression of NFAT-family proteins in normal human T cells. Mol. Cell. Biol. 17: 2475—2484. PMID 9111316 doi:10.1128/MCB.17.5.2475
Beals C.R., Sheridan C.M., Turck C.W., Gardner P., Crabtree G.R. (1997). Nuclear export of NF-ATc enhanced by glycogen synthase kinase-3. Science. 275: 1930—1934. PMID 9072970 doi:10.1126/science.275.5308.1930
Crabtree G.R. (1999). Generic signals and specific outcomes: signaling through Ca2+, calcineurin, and NF-AT. Cell. 96: 611—614. PMID 10089876 doi:10.1016/S0092-8674(00)80571-1

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7775 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O95644 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 18

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7775 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, O95644 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]