| RFX2
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| RFX2, regulatory factor X2 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 142765 MGI: 106583 HomoloGene: 30980 GeneCards: RFX2
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • цитоплазма
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • диференціація клітин • Сперматогенез • acrosome assembly • spermatid development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • cell projection organization • cilium assembly • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to leukemia inhibitory factor
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 19: 5.99 – 6.2 Mb
| Хр. 17: 57.08 – 57.14 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
RFX2 (англ. Regulatory factor X2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 723 амінокислот, а молекулярна маса — 79 987[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MQNSEGGADS
|
|
PASVALRPSA
|
|
AAPPVPASPQ
|
|
RVLVQAASSN
|
|
PKGAQMQPIS
|
| LPRVQQVPQQ
|
|
VQPVQHVYPA
|
|
QVQYVEGGDA
|
|
VYTNGAIRTA
|
|
YTYNPEPQMY
|
| APSSTASYFE
|
|
APGGAQVTVA
|
|
ASSPPAVPSH
|
|
SMVGITMDVG
|
|
GSPIVSSAGA
|
| YLIHGGMDST
|
|
RHSLAHTSRS
|
|
SPATLEMAIE
|
|
NLQKSEGITS
|
|
HKSGLLNSHL
|
| QWLLDNYETA
|
|
EGVSLPRSSL
|
|
YNHYLRHCQE
|
|
HKLDPVNAAS
|
|
FGKLIRSVFM
|
| GLRTRRLGTR
|
|
GNSKYHYYGI
|
|
RLKPDSPLNR
|
|
LQEDTQYMAM
|
|
RQQPMHQKPR
|
| YRPAQKTDSL
|
|
GDSGSHSGLH
|
|
STPEQTMAVQ
|
|
SQHHQQYIDV
|
|
SHVFPEFPAP
|
| DLGSFLLQDG
|
|
VTLHDVKALQ
|
|
LVYRRHCEAT
|
|
VDVVMNLQFH
|
|
YIEKLWLSFW
|
| NSKASSSDGP
|
|
TSLPASDEDP
|
|
EGAVLPKDKL
|
|
ISLCQCDPIL
|
|
RWMRSCDHIL
|
| YQALVEILIP
|
|
DVLRPVPSTL
|
|
TQAIRNFAKS
|
|
LEGWLTNAMS
|
|
DFPQQVIQTK
|
| VGVVSAFAQT
|
|
LRRYTSLNHL
|
|
AQAARAVLQN
|
|
TSQINQMLSD
|
|
LNRVDFANVQ
|
| EQASWVCQCE
|
|
ESVVQRLEQD
|
|
FKLTLQQQSS
|
|
LDQWASWLDS
|
|
VVTQVLKQHA
|
| GSPSFPKAAR
|
|
QFLLKWSFYS
|
|
SMVIRDLTLR
|
|
SAASFGSFHL
|
|
IRLLYDEYMF
|
| YLVEHRVAEA
|
|
TGETPIAVMG
|
|
EFNDLASLSL
|
|
TLLDKDDMGD
|
|
EQRGSEAGPD
|
| ARSLGEPLVK
|
|
RERSDPNHSL
|
|
QGI
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біогенез та деградація війок, диференціація клітин, сперматогенез, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|