| ZNF202
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| ZNF202, ZKSCAN10, ZSCAN42, zinc finger protein 202 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 603430 MGI: 1933401 HomoloGene: 68317 GeneCards: ZNF202
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв’язування з іоном металу • DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • внутрішньоклітинний
|
|---|
| Біологічний процес |
• Обмін жирів • transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 11: 123.72 – 123.74 Mb
| Хр. 9: 40.1 – 40.12 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
ZNF202 (англ. Zinc finger protein 202) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 648 амінокислот, а молекулярна маса — 74 720[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MATAVEPEDQ
|
|
DLWEEEGILM
|
|
VKLEDDFTCR
|
|
PESVLQRDDP
|
|
VLETSHQNFR
|
| RFRYQEAASP
|
|
REALIRLREL
|
|
CHQWLRPERR
|
|
TKEQILELLV
|
|
LEQFLTVLPG
|
| ELQSWVRGQR
|
|
PESGEEAVTL
|
|
VEGLQKQPRR
|
|
PRRWVTVHVH
|
|
GQEVLSEETV
|
| HLGVEPESPN
|
|
ELQDPVQSST
|
|
PEQSPEETTQ
|
|
SPDLGAPAEQ
|
|
RPHQEEELQT
|
| LQESEVPVPE
|
|
DPDLPAERSS
|
|
GDSEMVALLT
|
|
ALSQGLVTFK
|
|
DVAVCFSQDQ
|
| WSDLDPTQKE
|
|
FYGEYVLEED
|
|
CGIVVSLSFP
|
|
IPRPDEISQV
|
|
REEEPWVPDI
|
| QEPQETQEPE
|
|
ILSFTYTGDR
|
|
SKDEEECLEQ
|
|
EDLSLEDIHR
|
|
PVLGEPEIHQ
|
| TPDWEIVFED
|
|
NPGRLNERRF
|
|
GTNISQVNSF
|
|
VNLRETTPVH
|
|
PLLGRHHDCS
|
| VCGKSFTCNS
|
|
HLVRHLRTHT
|
|
GEKPYKCMEC
|
|
GKSYTRSSHL
|
|
ARHQKVHKMN
|
| APYKYPLNRK
|
|
NLEETSPVTQ
|
|
AERTPSVEKP
|
|
YRCDDCGKHF
|
|
RWTSDLVRHQ
|
| RTHTGEKPFF
|
|
CTICGKSFSQ
|
|
KSVLTTHQRI
|
|
HLGGKPYLCG
|
|
ECGEDFSEHR
|
| RYLAHRKTHA
|
|
AEELYLCSEC
|
|
GRCFTHSAAF
|
|
AKHLRGHASV
|
|
RPCRCNECGK
|
| SFSRRDHLVR
|
|
HQRTHTGEKP
|
|
FTCPTCGKSF
|
|
SRGYHLIRHQ
|
|
RTHSEKTS
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|