GATA3

GATA3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4HC7, 4HC9, 4HCA
Ідентифікатори
Символи	GATA3, HDR, HDRS, GATA binding protein 3
Зовнішні ІД	OMIM: 131320 MGI: 95663 HomoloGene: 1550 GeneCards: GATA3
Пов'язані генетичні захворювання
	ревматоїдний артрит, Гострий лімфобластний лейкоз, лімфогранульоматоз, hypoparathyroidism-deafness-renal disease syndrome
Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • HMG box domain binding; • chromatin binding; • зв’язування з іоном металу; • DNA binding; • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • interleukin-2 receptor binding; • core promoter sequence-specific DNA binding; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • protein dimerization activity; • E-box binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • zinc ion binding; • transcription factor binding; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001104 transcription coregulator activity;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • transcription regulator complex; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• negative regulation of cell population proliferation; • regulation of establishment of cell polarity; • ureteric bud formation; • negative regulation of cell cycle; • thymic T cell selection; • response to ethanol; • positive regulation of T cell differentiation; • erythrocyte differentiation; • inner ear morphogenesis; • cell maturation; • regulation of histone H3-K27 methylation; • cardiac right ventricle morphogenesis; • phosphatidylinositol 3-kinase signaling; • norepinephrine biosynthetic process; • ear development; • homeostasis of number of cells; • sympathetic nervous system development; • T-helper 2 cell differentiation; • regulation of cellular response to X-ray; • Детермінація; • Післязародковий розвиток; • cellular response to BMP stimulus; • mesonephros development; • neuron differentiation; • regulation of neuron apoptotic process; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • cellular response to cytokine stimulus; • cellular response to interleukin-4; • T cell receptor signaling pathway; • neuron migration; • positive regulation of interleukin-5 production; • regulation of CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation; • parathyroid gland development; • negative regulation of DNA demethylation; • positive regulation of interleukin-4 production; • negative regulation of mammary gland epithelial cell proliferation; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • thymus development; • нейробіологія розвитку; • otic vesicle development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of T-helper 2 cell cytokine production; • regulation of nephron tubule epithelial cell differentiation; • positive regulation of thyroid hormone generation; • lymphocyte migration; • negative regulation of interleukin-2 production; • regulation of neuron projection development; • uterus development; • axon guidance; • mesenchymal to epithelial transition; • negative regulation of cell proliferation involved in mesonephros development; • aortic valve morphogenesis; • cellular response to tumor necrosis factor; • negative regulation of fat cell differentiation; • anatomical structure morphogenesis; • cellular response to interferon-alpha; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • T cell differentiation; • response to virus; • negative regulation of endothelial cell apoptotic process; • вроджений імунітет; • canonical Wnt signaling pathway involved in metanephric kidney development; • positive regulation of transcription regulatory region DNA binding; • positive regulation of endothelial cell migration; • positive regulation of interleukin-13 production; • in utero embryonic development; • negative regulation of interferon-gamma production; • humoral immune response; • developmental growth; • розвиток нирки; • positive regulation of ureteric bud formation; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • mast cell differentiation; • positive regulation of histone H3-K9 acetylation; • positive regulation of cell differentiation; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • male gonad development; • nephric duct morphogenesis; • ventricular septum development; • GO:0032737 positive regulation of cytokine production; • lens development in camera-type eye; • negative regulation of fibroblast growth factor receptor signaling pathway involved in ureteric bud formation; • transcription, DNA-templated; • negative regulation of gene expression; • parathyroid hormone secretion; • nephric duct formation; • процес імунної системи; • negative regulation of inflammatory response; • pharyngeal system development; • embryonic organ development; • response to estrogen; • зсідання крові; • negative regulation of glial cell-derived neurotrophic factor receptor signaling pathway involved in ureteric bud formation; • positive regulation of signal transduction; • ureter maturation; • positive regulation of histone H3-K14 acetylation; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • response to gamma radiation; • GO:0000767 cell morphogenesis; • embryonic hemopoiesis; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of cell motility; • pro-T cell differentiation; • TOR signaling; • type IV hypersensitivity; • defense response; • regulation of histone H3-K4 methylation; • renal system development; • positive regulation of protein kinase B signaling; • cell activation; • ремоделювання хроматину; • T cell differentiation in thymus; • cochlea development; • transcription by RNA polymerase II; • protein deubiquitination; • anatomical structure formation involved in morphogenesis; • regulation of hematopoietic stem cell differentiation; • cytokine-mediated signaling pathway; • development of the heart; • animal organ morphogenesis; • гістогенез; • розвиток клітин; • digestive tract development; • immune system development; • regulation of epithelial cell differentiation; • ureter morphogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	2625
	14462
	ENSG00000107485
	ENSMUSG00000015619
	P23771
	P23772
	NM_001002295; NM_002051
	NM_008091; NM_001355110; NM_001355111; NM_001355112
	NP_001002295; NP_002042
	NP_032117; NP_001342039; NP_001342040; NP_001342041
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GATA3 (англ. GATA binding protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 443 амінокислот, а молекулярна маса — 47 916^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEVTADQPRW	VSHHHPAVLN	GQHPDTHHPG	LSHSYMDAAQ	YPLPEEVDVL
FNIDGQGNHV	PPYYGNSVRA	TVQRYPPTHH	GSQVCRPPLL	HGSLPWLDGG
KALGSHHTAS	PWNLSPFSKT	SIHHGSPGPL	SVYPPASSSS	LSGGHASPHL
FTFPPTPPKD	VSPDPSLSTP	GSAGSARQDE	KECLKYQVPL	PDSMKLESSH
SRGSMTALGG	ASSSTHHPIT	TYPPYVPEYS	SGLFPPSSLL	GGSPTGFGCK
SRPKARSSTG	RECVNCGATS	TPLWRRDGTG	HYLCNACGLY	HKMNGQNRPL
IKPKRRLSAA	RRAGTSCANC	QTTTTTLWRR	NANGDPVCNA	CGLYYKLHNI
NRPLTMKKEG	IQTRNRKMSS	KSKKCKKVHD	SLEDFPKNSS	FNPAALSRHM
SSLSHISPFS	HSSHMLTTPT	PMHPPSSLSF	GPHHPSSMVT	AMG

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Marine J., Winoto A. (1991). The human enhancer-binding protein Gata3 binds to several T-cell receptor regulatory elements. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 7284—7288. PMID 1871134 doi:10.1073/pnas.88.16.7284
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з GATA3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4172 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P23771 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 10

[1] Захворювання, генетично пов'язані з GATA3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4172 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P23771 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]