| GTF2H1
|
|---|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| GTF2H1, BTF2, P62, TFB1, TFIIH, general transcription factor IIH subunit 1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 189972 MGI: 1277216 HomoloGene: 3885 GeneCards: GTF2H1
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| рак підшлункової залози[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• protein kinase activity • ATP-dependent activity, acting on DNA • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity
|
|---|
| Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • transcription factor TFIIH holo complex • клітинне ядро • GO:0000441 transcription factor TFIIH core complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• termination of RNA polymerase I transcription • regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription initiation from RNA polymerase I promoter • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • 7-methylguanosine mRNA capping • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • global genome nucleotide-excision repair • transcription-coupled nucleotide-excision repair • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • nucleotide-excision repair, DNA incision • GO:0100026 Репарація ДНК • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • nucleotide-excision repair, preincision complex stabilization • nucleotide-excision repair • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • nucleotide-excision repair, preincision complex assembly • transcription by RNA polymerase I • phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain • nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding • nucleotide-excision repair, DNA incision, 3'-to lesion • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 11: 18.32 – 18.37 Mb
| Хр. 7: 46.45 – 46.47 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
GTF2H1 (англ. General transcription factor IIH subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 548 амінокислот, а молекулярна маса — 62 032[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MATSSEEVLL
|
|
IVKKVRQKKQ
|
|
DGALYLMAER
|
|
IAWAPEGKDR
|
|
FTISHMYADI
|
| KCQKISPEGK
|
|
AKIQLQLVLH
|
|
AGDTTNFHFS
|
|
NESTAVKERD
|
|
AVKDLLQQLL
|
| PKFKRKANKE
|
|
LEEKNRMLQE
|
|
DPVLFQLYKD
|
|
LVVSQVISAE
|
|
EFWANRLNVN
|
| ATDSSSTSNH
|
|
KQDVGISAAF
|
|
LADVRPQTDG
|
|
CNGLRYNLTS
|
|
DIIESIFRTY
|
| PAVKMKYAEN
|
|
VPHNMTEKEF
|
|
WTRFFQSHYF
|
|
HRDRLNTGSK
|
|
DLFAECAKID
|
| EKGLKTMVSL
|
|
GVKNPLLDLT
|
|
ALEDKPLDEG
|
|
YGISSVPSAS
|
|
NSKSIKENSN
|
| AAIIKRFNHH
|
|
SAMVLAAGLR
|
|
KQEAQNEQTS
|
|
EPSNMDGNSG
|
|
DADCFQPAVK
|
| RAKLQESIEY
|
|
EDLGKNNSVK
|
|
TIALNLKKSD
|
|
RYYHGPTPIQ
|
|
SLQYATSQDI
|
| INSFQSIRQE
|
|
MEAYTPKLTQ
|
|
VLSSSAASST
|
|
ITALSPGGAL
|
|
MQGGTQQAIN
|
| QMVPNDIQSE
|
|
LKHLYVAVGE
|
|
LLRHFWSCFP
|
|
VNTPFLEEKV
|
|
VKMKSNLERF
|
| QVTKLCPFQE
|
|
KIRRQYLSTN
|
|
LVSHIEEMLQ
|
|
TAYNKLHTWQ
|
|
SRRLMKKT
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|