| TOX2
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| TOX2, C20orf100, GCX-1, GCX1, dJ1108D11.2, dJ495O3.1, TOX high mobility group box family member 2 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 611163 MGI: 3611233 HomoloGene: 13155 GeneCards: TOX2
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| conduct disorder[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 20: 43.91 – 44.07 Mb
| Хр. 2: 163.05 – 163.17 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
TOX2 (англ. TOX high mobility group box family member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 488 амінокислот, а молекулярна маса — 51 604[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MQQTRTEAVA
|
|
GAFSRCLGFC
|
|
GMRLGLLLLA
|
|
RHWCIAGVFP
|
|
QKFDGDSAYV
|
| GMSDGNPELL
|
|
STSQTYNGQS
|
|
ENNEDYEIPP
|
|
ITPPNLPEPS
|
|
LLHLGDHEAS
|
| YHSLCHGLTP
|
|
NGLLPAYSYQ
|
|
AMDLPAIMVS
|
|
NMLAQDSHLL
|
|
SGQLPTIQEM
|
| VHSEVAAYDS
|
|
GRPGPLLGRP
|
|
AMLASHMSAL
|
|
SQSQLISQMG
|
|
IRSSIAHSSP
|
| SPPGSKSATP
|
|
SPSSSTQEEE
|
|
SEVHFKISGE
|
|
KRPSADPGKK
|
|
AKNPKKKKKK
|
| DPNEPQKPVS
|
|
AYALFFRDTQ
|
|
AAIKGQNPSA
|
|
TFGDVSKIVA
|
|
SMWDSLGEEQ
|
| KQSSPDQGET
|
|
KSTQANPPAK
|
|
MLPPKQPMYA
|
|
MPGLASFLTP
|
|
SDLQAFRSGA
|
| SPASLARTLG
|
|
SKSLLPGLSA
|
|
SPPPPPSFPL
|
|
SPTLHQQLSL
|
|
PPHAQGALLS
|
| PPVSMSPAPQ
|
|
PPVLPTPMAL
|
|
QVQLAMSPSP
|
|
PGPQDFPHIS
|
|
EFPSSSGSCS
|
| PGPSNPTSSG
|
|
DWDSSYPSGE
|
|
CGISTCSLLP
|
|
RDKSLYLT
|
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|