GTF2F1

GTF2F1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1F3U, 1I27, 1J2X, 1NHA, 1ONV, 2K7L, 5IY9, 5IYA, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5IYD, 5IY6
Ідентифікатори
Символи	GTF2F1, general transcription factor IIF, polypeptide 1, 74kDa, BTF4, RAP74, TF2F1, TFIIF, general transcription factor IIF subunit 1
Зовнішні ІД	OMIM: 189968 MGI: 1923848 HomoloGene: 1585 GeneCards: GTF2F1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • transcription factor binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • phosphatase activator activity; • RNA binding; • protein phosphatase binding; • protein domain specific binding; • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity; • promoter-specific chromatin binding;
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинна мембранна органела; • нуклеоплазма; • transcription factor TFIIF complex; • міжклітинні контакти; • transcription factor TFIID complex; • клітинне ядро; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • response to virus; • 7-methylguanosine mRNA capping; • transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of viral transcription; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • snRNA transcription by RNA polymerase II; • fibroblast growth factor receptor signaling pathway; • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity; • RNA metabolic process; • negative regulation of protein binding;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	2962
	98053
	ENSG00000125651
	ENSMUSG00000002658
	P35269
	Q3THK3
	NM_002096
	NM_133801
	NP_002087
	NP_598562
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GTF2F1 (англ. General transcription factor IIF subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 517 амінокислот, а молекулярна маса — 58 240^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAALGPSSQN	VTEYVVRVPK	NTTKKYNIMA	FNAADKVNFA	TWNQARLERD
LSNKKIYQEE	EMPESGAGSE	FNRKLREEAR	RKKYGIVLKE	FRPEDQPWLL
RVNGKSGRKF	KGIKKGGVTE	NTSYYIFTQC	PDGAFEAFPV	HNWYNFTPLA
RHRTLTAEEA	EEEWERRNKV	LNHFSIMQQR	RLKDQDQDED	EEEKEKRGRR
KASELRIHDL	EDDLEMSSDA	SDASGEEGGR	VPKAKKKAPL	AKGGRKKKKK
KGSDDEAFED	SDDGDFEGQE	VDYMSDGSSS	SQEEPESKAK	APQQEEGPKG
VDEQSDSSEE	SEEEKPPEED	KEEEEEKKAP	TPQEKKRRKD	SSEESDSSEE
SDIDSEASSA	LFMAKKKTPP	KRERKPSGGS	SRGNSRPGTP	SAEGGSTSST
LRAAASKLEQ	GKRVSEMPAA	KRLRLDTGPQ	SLSGKSTPQP	PSGKTTPNSG
DVQVTEDAVR	RYLTRKPMTT	KDLLKKFQTK	KTGLSSEQTV	NVLAQILKRL
NPERKMINDK	MHFSLKE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Dikstein R., Ruppert S., Tjian R. (1996). TAFII250 is a bipartite protein kinase that phosphorylates the base transcription factor RAP74. Cell. 84: 781—790. PMID 8625415 doi:10.1016/S0092-8674(00)81055-7
Rossignol M., Keriel A., Staub A., Egly J.-M. (1999). Kinase activity and phosphorylation of the largest subunit of TFIIF transcription factor. J. Biol. Chem. 274: 22387—22392. PMID 10428810 doi:10.1074/jbc.274.32.22387
Leong W.F., Chow V.T. (2006). Transcriptomic and proteomic analyses of rhabdomyosarcoma cells reveal differential cellular gene expression in response to enterovirus 71 infection. Cell. Microbiol. 8: 565—580. PMID 16548883 doi:10.1111/j.1462-5822.2005.00644.x
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 doi:10.1038/nbt1240
Gaiser F., Tan S., Richmond T.J. (2000). Novel dimerization fold of RAP30/RAP74 in human TFIIF at 1.7 A resolution. J. Mol. Biol. 302: 1119—1127. PMID 11183778 doi:10.1006/jmbi.2000.4110

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4652 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P35269 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4652 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P35269 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]